ヒト遺伝子発現の多様性の基盤となる機構のRNA塩基配列決定による解明

PICKRELL Joseph K.; MARIONI John C.; PAI Athma A.; DEGNER Jacob F.; ENGELHARDT Barbara E.; NKADORI Everlyne; VEYRIERAS Jean-Baptiste; STEPHENS Matthew; GILAD Yoav; PRITCHARD Jonathan K.

文献

J-GLOBAL ID：201002219103897500 整理番号：10A0355770

ヒト遺伝子発現の多様性の基盤となる機構のRNA塩基配列決定による解明

Understanding mechanisms underlying human gene expression variation with RNA sequencing

出版者サイト複写サービスで全文入手 {{ this.onShowCLink("http://jdream3.com/copy/?sid=JGLOBAL&noSystem=1&documentNoArray=10A0355770&COPY=1") }}
高度な検索・分析はJDreamⅢで {{ this.onShowJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=10A0355770&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=D0193B") }}

著者 (10件)： , , , , , , , , ,
資料名：
巻： 464 号： 7289 ページ： 768-772 発行年： 2010年04月01日
JST資料番号： D0193B ISSN： 0028-0836 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

遺伝子発現の自然なばらつきの基礎となる遺伝的機構の解明は,遺伝医学および進化遺伝学の両方の主要な目標である。また,発現量的形質遺伝子座(eQTL)の研究は,この目標を達成するための重要な手法となっている。現在までのeQTL研究はすべて,発現マイクロアレイを用いたメッセンジャーRNA量の解析だったが,RNA塩基配列決定法の最近の進歩によって,かつてないほど高い精度で転写産物の多様性を解析することが可能になった。我々は,国際HapMapプロジェクトで広く詳細な遺伝子型決定が行われた,血縁関係のないナイジェリア人集団から得られた,69のリンパ芽球様細胞株のRNAについて塩基配列を決定した。被験者すべてのデータを集積することで,これらの細胞の転写の全体像についてのマップを作製し,注釈が付けられていない非翻訳領域の大量使用や,新しいタンパク質をコードすると推定される100個以上のエキソンを同定した。HapMapプロジェクトの遺伝子型を使って,遺伝的多様性が全体的な発現量やスプライシングに影響を与えている1,000個以上の遺伝子を同定した。また,遺伝子近傍のeQTLは総じて,対立遺伝子特異的な発現などの機構によって機能すること,さらに,1つのエキソンを含むかどうかに影響する多様性が,スプライス部位のコンセンサス配列内やその近傍に豊富に存在することも示す。今回の結果は,個体集団全体の転写,スプライシング,および対立遺伝子特異的発現の多様性を統合して解析するために,ハイスループット塩基配列決定法が威力を発揮することを示している。Copyright Nature Publishing Group 2010

, , , , , , , , ,
,

遺伝子発現

, , , , ,

前のページに戻る