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J-GLOBAL ID：201002220683946365   整理番号：10A0484182

ある階層的文脈における種々の調節ネットワークの分析はミドルレベルの協力の一貫した傾向を示す

Analysis of diverse regulatory networks in a hierarchical context shows consistent tendencies for collaboration in the middle levels

著者 (3件)： BHARDWAJ Nitin (Yale Univ., CT) ,  YAN Koon-Kiu (Yale Univ., CT) ,  GERSTEIN Mark B. (Yale Univ., CT)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 15  ページ： 6841-6846  発行年： 2010年04月13日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 種々の生物種に対するいくつかの調節ネットワークを研究した。Mycobacterium tuberculosis(Mt),Escherichia coli(Ec),酵母(Sc),マウス(Mt),ラット(Rr)及びヒト(Mm)に対する転写(Tr),修飾(Mo),及びリン酸化(Ph)のうちデータが使えたSc_Ph, Hs_Mo, Hs_Tr, Rr_Tr, Mm_Tr, Sc_Tr, Ec_Tr, Mt_trを分析した。調節子のレベルは他を調節するのみのトップ,されるのみのボトム,及び中間のミドルで最低の四番目のレベルにある標的を集団的に支配するこの3レベルの詳細を述べた。協力の度合及び専制的対民主的特性を測るノード,レベル,及び全体ネットワークの量を規定した。個々の調節子はある範囲のパートナーシップ傾向を持つことを示した。すなわちいくつかは標的を民主的構造の局部的な具体例で他の調節子との組み合わせで調節するのに対して,他はもっと専制的様式で大抵単独で調節した。全体的に,研究した全てのネットワークにおいてミドルレベルが最高の協力的傾向を持ち,共調節共同が中位の調節子の中でもっとも頻繁に起こることを示した。しかし異なる種のネットワークの間には顕著な差異があり,協力的調節及び民主的な特性の量はゲノムの全体的な複雑さとともに増えた。たとえば調節子及び標的の数は酵素では250及び6000(標的数平均約25)に対しヒトでは2000及び20000(標的数平均約10)であった。

シソーラス用語： *調節遺伝子 ,  *階層構造 ,  結核菌 ,  大腸菌 ,  酵母菌属 ,  ヒト ,  リン酸化 ,  転写【遺伝】 ,  調整 ,  ネットワーク ,  分子間相互作用
準シソーラス用語： *遺伝子調節ネットワーク ,  生体調節 ,  蛋白質機能

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (5件)： 文脈 ,  調節ネットワーク ,  分析 ,  協力 ,  傾向