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J-GLOBAL ID：201002221688453207   整理番号：10A1320916

統計的に最適なヌルフィルタを用いる比較ゲノム解析

Comparative Genomic Analysis using Statistically Optimal Null Filters

著者 (3件)： KAKUMANI Rajasekhar (Concordia Univ., Quebec, CAN) ,  AHMAD M. Omair (Concordia Univ., Quebec, CAN) ,  DEVABHAKTUNI Vijay (Univ. Toledo, OH, USA)
資料名： IEEE International Symposium on Circuits and Systems  (IEEE International Symposium on Circuits and Systems)
巻： 2010 Vol.4  ページ： 2235-2238  発行年： 2010年 
JST資料番号： A0757A  ISSN： 0271-4302  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 短時間信号を効率的に推定できるSONF(統計的に最適なヌルフィルタ)を用いてゲノム配列中の局所整列度を比較する手法を提案した。質問配列である特定のモチーフの発生に対して解析すべきゲノム配列を提案の手法に入力した。瞬時整合フィルタに基づくSONFは,最大SN比と最小二乗(LS)最適化基準を用いてターゲット配列中のモチーフの存在位置を検出する。実験結果は,配列が短くとも提案の手法は大型ターゲット配列中の高相関性位置を特定できることを示した。

シソーラス用語： 最適フィルタ ,  信号推定 ,  *ヌクレオチド配列 ,  整合フィルタ ,  SN比 ,  最小二乗法 ,  位置決め ,  アラインメント
準シソーラス用語： *ゲノム解析 ,  モチーフ ,  遺伝子情報処理 ,  順序統計フィルタ ,  比較ゲノミクス

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： 統計 ,  比較ゲノム ,  解析