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J-GLOBAL ID：201002222878970760   整理番号：10A0873128

TaqMan蛍光プローブを用いた実時間PCRによるサンゴ病原菌Vibrio coralliilyticusの検出と定量化

Detection and Quantification of the Coral Pathogen Vibrio coralliilyticus by Real-Time PCR with TaqMan Fluorescent Probes

著者 (9件)： POLLOCK F. Joseph (Australian Inst. of Marine Sci., Townsville, AUS) ,  POLLOCK F. Joseph (Coll. of Charleston, South Carolina) ,  POLLOCK F. Joseph (Hollings Marine Lab., South Carolina) ,  POLLOCK F. Joseph (James Cook Univ., Townsville, AUS) ,  MORRIS Pamela J. (Coll. of Charleston, South Carolina) ,  MORRIS Pamela J. (Hollings Marine Lab., South Carolina) ,  MORRIS Pamela J. (Univ. South Carolina, South Carolina) ,  WILLIS Bette L. (James Cook Univ., Townsville, AUS) ,  BOURNE David G. (Australian Inst. of Marine Sci., Townsville, AUS)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 76  号： 15  ページ： 5282-5286  発行年： 2010年08月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サンゴ病原海洋細菌V.coralliilyticusの熱ショック蛋白質40をコードする遺伝子(dnaJ)を標的とするTaqManに基づく実時間定量的PCR(qPCR)アッセイの開発と確認について記述した。最適条件下でV.coralliilyticusの分離株,非標的Vibrio種,他の細菌種から抽出したDNAを用いてqPCR法を最適化し,検討した標題菌の13株のうちCaribbean株を除いた12株は本qPCR法で特異的に検出できることを明らかにした。特異的な検出はさらにゲル電気泳動法で確認した。精製した本菌株のゲノムDNAの検出限界を10倍希釈法に基づいて試験した結果,0.1pg DNAであった。また,サンゴ組織1cm²当り10⁴CFUであった。海水中に接種したV.coralliilyticusの細胞の最小検出限界は1 CFU/mlであった。

シソーラス用語： *Vibrio ,  海洋微生物 ,  PCR法 ,  *熱ショックタンパク質 ,  細菌検査 ,  生物分類 ,  花虫類 ,  生態系 ,  環境被害 ,  *珊瑚礁
準シソーラス用語： *DnaJ蛋白質 ,  TaqMan ,  TaqMan PCR法 ,  *Vibrio coralliilyticus

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  生態系  (EE01040P)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蛍光プローブ ,  実時間 ,  PCR ,  サンゴ ,  病原菌 ,  Vibrio ,  定量化