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J-GLOBAL ID：201002223763748725   整理番号：10A1381755

遺伝子経路とサブネットワークは主要な神経膠腫サブタイプ間の区別を行い根底にある可能な生物学を解明する

Gene pathways and subnetworks distinguish between major glioma subtypes and elucidate potential underlying biology

著者 (9件)： WUCHTY Stefan (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  ZHANG Alice (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  WALLING Jennifer (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  AHN Susie (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  LI Aiguo (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  QUEZADO Martha (NCI Center for Biomedical Informatics and Information Technol., National Cancer Inst., National Institutes of ...) ,  OBERHOLTZER Carl (NCI Center for Biomedical Informatics and Information Technol., National Cancer Inst., National Institutes of ...) ,  ZENKLUSEN Jean-claude (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...) ,  FINE Howard A. (Neuro-Oncology Branch, National Cancer Inst., National Institutes of Neurological Disorder and Stroke, National ...)
資料名： Journal of Biomedical Informatics  (Journal of Biomedical Informatics)
巻： 43  号： 6  ページ： 945-952  発行年： 2010年12月 
JST資料番号： B0827A  ISSN： 1532-0464  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子診断ツールは,主なヒト脳腫瘍をより正確に分類する試みに盛んに用いられつつある。個々の遺伝子発現の解析に基づく方法は,診断目的に役立つことが分かっているが,腫瘍形成が単一遺伝子ではなく複数経路の協調した脱調節であるので,生物学的意義を欠いている。概念実証において,二つの大規模臨床データセットを利用し,濃縮された経路及び蛋白質相互作用の発現に差がある小さなサブネットワークの解明が,膠芽腫と乏突起膠腫の信頼性の高い分類を可能にすることを示す。特徴選択法を応用し,経路とサブネットワークの最適化された部分集合が予測精度を有意に改善することを見る。経路とサブネットワークにおける変化を起こした遺伝子の濃縮を決定することにより,遺伝子の最適化部分集合がめったにゲノム異常のターゲットにならないらしいことを示す。得られた結果は,腫瘍のタイプを高い信頼性で区別するために利用できる基礎となる腫瘍サンプルのフェノタイプに対して,遺伝子のグループが決定的な役割を果たしていることを示唆している。ゲノム的に変化した遺伝子の濃縮が無い場合,腫瘍を規定するいくつかの調節ネットワークに対する直接的というより間接的な調節の影響を,主に遺伝的変化が及ぼしているということを受け入れる。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *脳腫瘍 ,  *遺伝子診断 ,  経路 ,  ネットワーク ,  遺伝的調節 ,  転写【遺伝】 ,  遺伝子発現 ,  形質発現 ,  分子間相互作用 ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  分子遺伝現象 ,  膠芽腫 ,  表現型 ,  分類 ,  特徴選択 ,  ヒト
準シソーラス用語： ゲノム異常 ,  サブネットワーク ,  遺伝子経路 ,  蛋白質相互作用 ,  分子診断 ,  乏突起膠腫

分類 (4件)： 神経系の腫よう  (GN04000V) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  臨床診断学  (GC03003G)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子 ,  経路 ,  サブネットワーク ,  神経膠腫 ,  サブタイプ ,  生物学