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J-GLOBAL ID：201002231660568489   整理番号：10A0127110

16S rRNA遺伝子配列分析による超アキュムレータのAlyssum muraleの根圏におけるニッケル抵抗性細菌の特性付け

Characterization of Ni-resistant bacteria in the rhizosphere of the hyperaccumulator Alyssum murale by 16S rRNA gene sequence analysis

著者 (8件)： ABOU-SHANAB R. A. I. (Mubarak City for Scientific Res., Alexandria, EGY) ,  VAN BERKUM P. (ARS, United States Dep. of Agriculture, MD, USA) ,  ANGLE J. S. (Univ. Georgia, GA, USA) ,  DELORME T. A. (Kent State Univ. Ashtabula, OH, USA) ,  CHANEY R. L. (ARS, United States Dep. of Agriculture, MD, USA) ,  GHOZLAN H. A. (Univ. Alexandria, Alexandria, EGY) ,  GHANEM K. (Univ. Alexandria, Alexandria, EGY) ,  MOAWAD H. (National Res. Center, Cairo, EGY)
資料名： World Journal of Microbiology & Biotechnology  (World Journal of Microbiology & Biotechnology)
巻： 26  号： 1  ページ： 101-108  発行年： 2010年01月 
JST資料番号： T0482A  ISSN： 0959-3993  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ニッケルを多量に含む蛇紋岩土壌で生育するニッケルの超アキュムレータのAlyssum murale(アブラナ科)の根圏およびバルク土壌から分離した184の菌株の多様性を,16S rRNA分析によって調べた。16S rRNA遺伝子の限定的消化によって,44グループを同定した。16S rRNA遺伝子配列分析によって,これら各グループの標本をProteobacteria門,Firmicutes門,Actinobacteria門に位置付けた。16S rRNA遺伝子の制限データと遺伝子配列分析とを組合わせた結果,分離菌株の44.6%(82/184)はProteobacteria門に含まれ,これらのなかの35.9%(66/184)はα-Proteobacteriaクラスに位置し,20.7%(38/184)はマメ科共生菌を示す16S rRNA遺伝子配列を有した。その他の分離株では,44.6%(82/184)がActinobacteria門に,5.4%(10/184)がFirmicutes門に位置付けられた。残りの分離株(10/184)は分類位置は明確にならなかった。16S rRNA遺伝子配列法によってA.muraleの根圏細菌を特性付けすることができた。

シソーラス用語： *アブラナ科 ,  根圏 ,  土壌微生物 ,  ニッケル ,  蛇紋岩 ,  rRNA遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  ミクロフローラ ,  生物多様性 ,  細菌
準シソーラス用語： *Alyssum murale ,  根圏微生物 ,  16S rRNA遺伝子 ,  プロテオバクテリア ,  Firmicutes ,  Actinobacteria

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： rRNA遺伝子 ,  配列分析 ,  Alyssum ,  根圏 ,  ニッケル ,  抵抗性細菌 ,  特性付け