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J-GLOBAL ID：201002234886296880   整理番号：10A0284702

蛋白質構造の正確な描写,FragBagは迅速かつ精密に全PDBから構造隣接部を回収する

FragBag, an accurate representation of protein structure, retrieves structural neighbors from the entire PDB quickly and accurately

著者 (3件)： BUDOWSKI-TAL Inbal (Univ. Haifa, Haifa, ISR) ,  NOV Yuval (Univ. Haifa, Haifa, ISR) ,  KOLODNY Rachel (Univ. Haifa, Haifa, ISR)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 8  ページ： 3481-3486  発行年： 2010年02月23日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質構造を比較するための超高速でかつ正確な方法,FragBagについて紹介した。重複する短い連続バックボーンセグメントを集めて蛋白質構造を明らかにし,各々のセグメントの出現数を計測するベクター間の類似性により2つの構造の類似性を測定した。全蛋白質データバンク(PDB)の迅速な構造検索エンジンの実行のための逆インデックス構築に際してこの手法を利用し,サブ構造の集積として構造を特定した。

シソーラス用語： *データベース ,  立体配座 ,  アミノ酸配列 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  構造解析 ,  検索エンジン ,  *タンパク質
準シソーラス用語： *蛋白質データバンク

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質構造 ,  PDB ,  隣接部