文献

J-GLOBAL ID：201002235889236728   整理番号：10A0846495

CE-TOFMSデータにおける正確な質量,移動時間予測及び同位体パターン情報からの代謝産物の同定予測

Prediction of metabolite identity from accurate mass, migration time prediction and isotopic pattern information in CE-TOFMS data

著者 (10件)： SUGIMOTO Masahiro (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  SUGIMOTO Masahiro (Keio Univ., Kanagawa, JPN) ,  HIRAYAMA Akiyoshi (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  ROBERT Martin (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  ROBERT Martin (Keio Univ., Kanagawa, JPN) ,  ABE Shinobu (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  SOGA Tomoyoshi (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  SOGA Tomoyoshi (Keio Univ., Kanagawa, JPN) ,  TOMITA Masaru (Keio Univ., Yamagata, JPN) ,  TOMITA Masaru (Keio Univ., Kanagawa, JPN)
資料名： Electrophoresis  (Electrophoresis)
巻： 31  号： 14  ページ： 2311-2318  発行年： 2010年07月 
JST資料番号： A0626B  ISSN： 0173-0835  CODEN： ELCTDN  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： キャピラリー電気泳動-飛行時間型質量分析(CE-TOFMS)における質量,移動時間(t_m)及び同位体パターン情報からの代謝産物の同定を研究した。標準カチオン代謝産物375とサポートベクトル回帰を用いた予測モデルを開発し,予測及び測定t_mの良好な相関を確認した。この訓練モデルを用いることで,データベースで利用できる代謝産物2938のt_mを予測し,ヒト尿試料を特性化することができた。標準ライブラリー単独でのマッチングによって38.9%のピークを帰属させたが,その比率は52.2%まで増加した。提案アプローチはCE-TOFMSプロフィーリングからのメタボロミクスデータセットの解析に有効なものと考察した。

シソーラス用語： *キャピラリー電気泳動 ,  飛行時間法 ,  *質量分析 ,  *代謝産物 ,  予測技法 ,  同位体存在比 ,  イオン移動度 ,  質量スペクトル ,  データ処理 ,  データ解析 ,  交差検証法 ,  データベース ,  予測誤差 ,  *ケモメトリックス ,  測定精度 ,  *尿中排泄 ,  ヒト ,  サポートベクトルマシン ,  回帰モデル ,  数学 ,  誤差論

分類 (3件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  生体物質一般  (EB02010G) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (7件)： CE-TOFMS ,  質量 ,  移動時間 ,  予測 ,  同位体パターン ,  代謝産物 ,  同定