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J-GLOBAL ID：201002236215607689   整理番号：10A0707781

タンデム飛行時間型質量分析計での157nm光解離を用いるペプチドデノボ配列

Peptide de Novo Sequencing Using 157 nm Photodissociation in a Tandem Time-of-Flight Mass Spectrometer

著者 (2件)： ZHANG Liangyi (Indiana Univ., Indiana) ,  REILLY James P. (Indiana Univ., Indiana)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 82  号： 3  ページ： 898-908  発行年： 2010年02月01日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは先にマトリックス支援レーザ脱離/イオン化タンデム飛行時間型質量分析計におけるトリプシンペプチドイオンの157nmでの光解離で,x-型イオンを生成することを明らかにしたが,これに関連して,本研究ではこれらのデータを解析するためのペプチドデノボ配列決定アルゴリズムを開発した。光解離及びポストソース崩壊スペクトルの組み合わせによって,このアルゴリズムではx-型イオンを識別し,ペプチドシーケンスを導くことができた。モデル蛋白質4種からのトリプシンペプチド31種の分析において,このアルゴリズムではアミノ酸355種のうち,322種を識別したが,他のアミノ酸については特定のx-型イオンを検出することができなかったため,識別できなかった。また観察されたv-型及びw-型イオンに基づいて,50種のロイシン及びイソロイシン残基のうちの45種をよく識別することができた。さらにこの配列決定アプローチのロバスト性を評価するため,モデル蛋白質23種からトリプシンペプチド266種を分析し,配列決定を試みた。

シソーラス用語： *ペプチド ,  *アミノ酸配列 ,  *光解離 ,  *MALDI-TOF MS ,  *スペクトル解析 ,  *アルゴリズム ,  脱着 ,  タンデム質量分析 ,  イオン化 ,  質量スペクトル ,  分子認識 ,  遺伝学実験技術 ,  アミノ酸残基 ,  ヘモグロビン ,  ミオグロビン ,  チトクロームc ,  ユビキチン ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸 ,  第一アミン ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  *飛行時間法
準シソーラス用語： PSD【脱着】 ,  シーケンス解析

分類 (4件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  光化学反応  (CB08020F) ,  質量分析  (CC03013N) ,  質量スペクトル(分子)  (BH06100V)

物質索引 (3件)： イソロイシン ,  フェニルアラニン ,  ロイシン

タイトルに関連する用語 (3件)： タンデム ,  飛行時間型質量分析計 ,  光解離