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J-GLOBAL ID：201002237943687610   整理番号：10A1033420

MspAを用いたナノポアDNA配列決定

Nanopore DNA sequencing with MspA

著者 (7件)： DERRINGTON Ian M. (Univ. Washington, WA) ,  BUTLER Tom Z. (Univ. Washington, WA) ,  COLLINS Marcus D. (Univ. Washington, WA) ,  MANRAO Elizabeth (Univ. Washington, WA) ,  PAVLENOK Mikhail (Univ. Alabama at Birmingham, AL) ,  NIEDERWEIS Michael (Univ. Alabama at Birmingham, AL) ,  GUNDLACH Jens H. (Univ. Washington, WA)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 37  ページ： 16060-16065  発行年： 2010年09月14日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 八量体で長さ約0.5nmのすり鉢様筒構造とその底部開口部に半径約1.2nmのナノポアを形成するMycobacterium smegmatisポリンA(MspA)を用いたDNA配列決定法の確立を目指し,ポアを通過させるDNAの構成と通過時のイオン電流との関連を調べた。50塩基の一本鎖に14塩基対の二本鎖ヘアピン構造が続くモデルDNAを電気的にMspA内に誘導し,MspA内にトラップされたヘアピン部分が解離しながらナノポアを通過する約10ミリ秒間のイオン電流を測定したところ,配列中の各塩基に特有の電流値が連続的に記録された。測定値の分解能に影響する一本鎖DNA組成を検討し,配列既知,配列未知それぞれのモデルDNAを適用して,本方法によるDNA配列決定が可能であることを検証した。

シソーラス用語： *ポリン ,  細菌タンパク質 ,  一本鎖DNA ,  ヘアピン構造 ,  核酸塩基 ,  *ヌクレオチド配列 ,  電流 ,  細孔 ,  脂質二分子膜 ,  膜電流 ,  Mycolicibacterium smegmatis ,  ナノ細孔 ,  *膜貫通タンパク質 ,  微生物 ,  マイコバクテリウム属 ,  放線菌目
準シソーラス用語： Mycobacterium smegmatis ,  *MspA蛋白質 ,  ナノポア

分類 (2件)： 生物物理的研究法  (EA03020V) ,  生体膜一般  (EF04010G)

タイトルに関連する用語 (3件)： MSPA ,  ナノポア ,  DNA配列