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J-GLOBAL ID：201002238799048077   整理番号：10A0432768

多重最小基準モード解析からの集団運動のロバストな記述の一致モード HIV-1プロテアーゼへの応用

Consensus modes, a robust description of protein collective motions from multiple-minima normal mode analysis-application to the HIV-1 protease

著者 (9件)： BATISTA Paulo Ricardo (Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, BRA) ,  BATISTA Paulo Ricardo (Univ. Paris-Sud 11, Orsay, FRA) ,  ROBERT Charles Herbert (Univ. Paris-Sud 11, Orsay, FRA) ,  ROBERT Charles Herbert (Inst. Biologie Physico Chimique, Paris, FRA) ,  MARECHAL Jean-Didier (Universitat Autonoma de Barcelona, Catalonia, ESP) ,  HAMIDA-REBAIE Meriam Ben (Univ. Paris-Sud 11, Orsay, FRA) ,  PASCUTTI Pedro Geraldo (Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, BRA) ,  BISCH Paulo Mascarello (Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, BRA) ,  PERAHIA David (Univ. Paris-Sud 11, Orsay, FRA)
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 12  号： 12  ページ： 2850-2859  発行年： 2010年03月28日 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質の柔軟性は,基本的には酵素機能,配位子結合及び蛋白質-蛋白質または蛋白質-核酸相互作用に依存する。そのような柔軟性の研究に基準モード解析は重要である。本研究では,蛋白質の多重最小において存在する調和的情報の解析に注目する。基準モードは複雑なエネルギー面上の特殊な最小を反映する単一の構造に厳密には対応する。標準的基準モード解析よりもよりロバストな,かつ高い集団的及び対称的性質をもつ,一連の関連構造からの「一致」基準モードを決定するための新しい理論的骨格を記述した。HIV-1プロテアーゼへの応用を例示した。

シソーラス用語： *基準モード ,  *モード解析 ,  集団模型 ,  タンパク質 ,  調和解析 ,  ポテンシャルエネルギー面 ,  *HIV1 ,  *プロテイナーゼ
準シソーラス用語： 集団運動模型

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  高分子の立体構造  (CG02031G)

タイトルに関連する用語 (7件)： 多重 ,  基準モード解析 ,  集団運動 ,  ロバスト ,  記述 ,  プロテアーゼ ,  応用