CpG島は,CpG結合タンパク質Cfp1を介してクロマチン構造に影響を及ぼす

THOMSON John P.; SKENE Peter J.; SELFRIDGE Jim; CLOUAIRE Thomas; GUY Jacky; WEBB Shaun; KERR Alastair R. W.; DEATON Aimee; ANDREWS Rob; JAMES Keith D.; TURNER Daniel J.; ILLINGWORTH Robert; BIRD Adrian

文献

J-GLOBAL ID：201002239393756867 整理番号：10A0400876

CpG島は,CpG結合タンパク質Cfp1を介してクロマチン構造に影響を及ぼす

CpG islands influence chromatin structure via the CpG-binding protein Cfp1

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資料名：
巻： 464 号： 7291 ページ： 1082-1086 発行年： 2010年04月15日
JST資料番号： D0193B ISSN： 0028-0836 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

哺乳類ゲノムではCpG島(CGI)が目立って多いが,それは,GCの多い塩基組成とCpGジヌクレオチド密度の高さのためである。ヒトの遺伝子プロモーターのほとんどは,転写活性にかかわらず,DNAメチル化されていないCGI中にあり,それはヒストンH3リジン4トリメチル化(H3K4me3)部位と一致する。このような興味をそそる関連性があるものの,非メチル化CGI配列がクロマチン構造と転写に,機能的にどのような意味をもつかはわかっていない。今回我々は,あらゆるCGIに共通にみられるタンパク質を探索し,in vitroで非メチル化CpGに選択的に結合するCfp1が,CGIに特に多く集まっていることを示す。一方の対立遺伝子だけがメチル化されたCGIでクロマチン免疫沈降実験を行い,in vivoでCfp1が非メチル化CpG部位に特異的に結合することを確かめた。Cfp1結合クロマチンのハイスループットシーケンシングにより,マウス脳内では,非メチル化CGIとH3K4me3部位が明らかに一致することがわかった。Cfp1欠失細胞ではCGIのH3K4me3レベルが著しく低下しており,これは,Cfp1がH3K4メチルトランスフェラーゼSetd1と結合するという知見と一致する。非メチル化CpG密度の高い配列の存在だけでH3K4me3領域の確立に十分かどうかを調べるため,人工的にCpGクラスターをマウスゲノムに組み込んで分析した。挿入したクラスターは,プロモーターがなくてもCfp1を引き寄せ,新たなH3K4me3のピークが生じた。これらのデータから,非メチル化CGIの主な機能は,Cpf1やおそらくはほかのCpG結合タンパク質との相互作用を介して遺伝的に,局所的なクロマチン修飾に影響を及ぼすことだと考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2010

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遺伝子発現

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