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J-GLOBAL ID：201002241364472080   整理番号：10A0204134

多遺伝子座配列分析によるヨーロッパの海からのRhodopirellulaの多様性分析

Determination of the Diversity of Rhodopirellula Isolates from European Seas by Multilocus Sequence Analysis

著者 (7件)： WINKELMANN Nadine (Max Planck Inst. for Marine Microbiology, Bremen, DEU) ,  JAEKEL Ulrike (Max Planck Inst. for Marine Microbiology, Bremen, DEU) ,  MEYER Carolin (Univ. Regensburg, Regensburg, DEU) ,  SERRANO Wilbert (Univ. Bremen, Bremen, DEU) ,  RACHEL Reinhard (Univ. Regensburg, Regensburg, DEU) ,  ROSSELLO-MORA Ramon (UIB, Illes Balears, ESP) ,  HARDER Jens (Max Planck Inst. for Marine Microbiology, Bremen, DEU)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 76  号： 3  ページ： 776-785  発行年： 2010年02月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヨーロッパの海19か所から分離した13の操作的分類単位(OTU)に属する70株のR.baltica関連菌株の多遺伝子座配列分析(MLSA)を行った。Rhodopirellula balticaのMLSA法開発は16S rRNA遺伝子分析ではできなかった種レベルの遺伝子多様性分析を可能にした。acsA,guaA,trpE,purH,glpF,fumC,icd,glyA,mdhのアレル分析によって13のOTUを認めた。MLSAによるOTUはDNA-DNAハイブリダイゼーション法による分類学的ユニットと一致した。BOX-PCRは近縁のOTUのMLSAによる識別を支持した。バルチック海,東北海,北大西洋に3種の近縁R.balticaが生息した。OTU Aはキール湾(ドイツ),北海東沿岸,地中海に限定され,OTU Bは南北海,地中海に見られた。他のOTUは菌数が少なく生息地の特定はできなかった。

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  *海洋微生物 ,  *細菌 ,  ヨーロッパ ,  *細菌検査 ,  PCR法 ,  生物多様性 ,  生物分類 ,  系統樹 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  生息場所 ,  地理的分布
準シソーラス用語： *MLSA ,  海洋細菌 ,  *Rhodopirellula baltica ,  BOX-PCR ,  遺伝子多様性

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子座 ,  配列分析 ,  ヨーロッパ ,  海 ,  多様性 ,  分析