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J-GLOBAL ID：201002242745738296   整理番号：10A1745676

発現データの予測反応関連クラスタリングは疾患過程に関する洞察を提供する

Predictive response-relevant clustering of expression data provides insights into disease processes

著者 (10件)： HOPCROFT Lisa E. M. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  MCBRIDE Martin W. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  HARRIS Keith J. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  SAMPSON Amanda K. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  MCCLURE John D. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  GRAHAM Delyth (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  YOUNG Graham (Univ. Glasgow, Glasgow, GBR) ,  HOLYOAKE Tessa L. (Univ. Glasgow, Glasgow, GBR) ,  GIROLAMI Mark A. (Univ. Glasgow, Glasgow) ,  DOMINICZAK Anna F. (Univ. Glasgow, Glasgow)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 38  号： 20  ページ： 6831-6840  発行年： 2010年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 「反応関連」遺伝子のクラスター生成のための,モデルに基づくクラスタリングと二成分分類を結合するマイクロアレイデータの新しい分析法について述べる。プロビット回帰モデルにおいてクラスターの「メタ共変動」表現と呼ぶ各遺伝子クラスターの適切な統計的要約を用いて,予測を行った。白血病発現データセットの解析のよりこの手法を例証し,次に塩感受性高血圧ラットモデルにおける腎臓遺伝子発現データセットのメタ共変動分析に焦点を当てた。高度に影響力のある13の遺伝子のクラスターを同定した。これは増加した食餌中の食塩に反応した高血圧に対し保護的であることが暗示されている3つの転写因子を含んだ。

シソーラス用語： 回帰モデル ,  *クラスタ形成 ,  クラスタ ,  *白血病 ,  *予測技法 ,  転写因子 ,  高血圧症 ,  *DNAマイクロアレイ ,  DNA結合タンパク質 ,  日周期
準シソーラス用語： 遺伝子クラスタ ,  Arnt1 ,  Bhlhe41 ,  NPAS2

分類 (2件)： 情報処理一般  (JE15010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 発現 ,  予測 ,  クラスタリング ,  疾患 ,  過程 ,  洞察