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J-GLOBAL ID：201002242965947740   整理番号：10A0026913

細菌および古細菌に関する系統学主導のゲノム百科

A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea

著者 (38件)： WU Dongying (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  WU Dongying (Univ. California, California, USA) ,  HUGENHOLTZ Philip (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  MAVROMATIS Konstantinos (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  PUKALL Ruediger (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  DALIN Eileen (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  IVANOVA Natalia N. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  KUNIN Victor (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  GOODWIN Lynne (DOE Joint Genome Inst.-Los Alamos National Lab., California, USA) ,  WU Martin (Univ. Virginia, Virginia, USA) ,  TINDALL Brian J. (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  HOOPER Sean D. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  PATI Amrita (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  LYKIDIS Athanasios (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  SPRING Stefan (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  ANDERSON Iain J. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  D’HAESELEER Patrik (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  D’HAESELEER Patrik (Lawrence Livermore National Lab., California, USA) ,  ZEMLA Adam (Lawrence Livermore National Lab., California, USA) ,  SINGER Mitchell (Univ. California, California, USA) ,  LAPIDUS Alla (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  NOLAN Matt (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  COPELAND Alex (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  HAN Cliff (DOE Joint Genome Inst.-Los Alamos National Lab., California, USA) ,  CHEN Feng (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  CHENG Jan-Fang (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  LUCAS Susan (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  KERFELD Cheryl (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  LANG Elke (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  GRONOW Sabine (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  CHAIN Patrick (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  CHAIN Patrick (DOE Joint Genome Inst.-Los Alamos National Lab., California, USA) ,  BRUCE David (DOE Joint Genome Inst.-Los Alamos National Lab., California, USA) ,  RUBIN Edward M. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  KYRPIDES Nikos C. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  KLENK Hans-Peter (DSMZ, Braunschweig, DEU) ,  EISEN Jonathan A. (DOE Joint Genome Inst., California, USA) ,  EISEN Jonathan A. (Univ. California, California, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 462  号： 7276  ページ： 1056-1060  発行年： 2009年12月24日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌および古細菌のゲノム塩基配列解読によって,微生物が果たしている多くの役割に関する理解に大変革がもたらされた。現在,1,000種近い細菌および古細菌の全ゲノム塩基配列が明らかになっているが,そのほとんどは生理学的特性に基づいて塩基配列解読の対象に選ばれている。結果として,対象種の分布は系統学的には極めて偏ることになり,現在利用可能なゲノム塩基配列データから得られる展望は限定されている。ゲノム解読対象とする微生物を進化上の類縁関係に基づいて選択することで付加される有用性を検討するため,我々は,系統学的なカバー率が最大となるように選択した培養可能な細菌および古細菌56種のゲノム塩基配列を解読し,それらを分析した。この分析結果から,系統発生史の再構築,新規タンパク質ファミリーや生物学的特性の発見,他種生物の既知遺伝子に関する機能予測などのさまざまな領域で,(既存のデータベースから無作為に選択した同等のゲノム群と比較して)大きな成果が得られた。今回の結果は,既存の微生物ゲノムデータや今後解読されるゲノムから最大限の情報を導き出すために,系統学主導で「細菌および古細菌のゲノム百科」をまとめる体系的な「系統ゲノム」研究の必要性を強く裏付けている。Copyright Nature Publishing Group 2009

シソーラス用語： 古細菌 ,  細菌 ,  *ゲノム ,  *系統発生 ,  ヌクレオチド配列 ,  分子進化 ,  系統樹

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 細菌 ,  古細菌 ,  系統学 ,  ゲノム