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J-GLOBAL ID：201002251588500247   整理番号：10A0544206

核酸ハイブリッド化の定量のための光開始剤ヌクレオチド

Photoinitiator Nucleotide for Quantifying Nucleic Acid Hybridization

著者 (5件)： JOHNSON Leah M. (Univ. Colorado, Colorado) ,  HANSEN Ryan R. (Univ. Colorado, Colorado) ,  URBAN Milan (Univ. Colorado, Colorado) ,  KUCHTA Robert D. (Univ. Colorado, Colorado) ,  BOWMAN Christopher N. (Univ. Colorado, Colorado)
資料名： Biomacromolecules  (Biomacromolecules)
巻： 11  号： 4  ページ： 1133-1138  発行年： 2010年04月 
JST資料番号： W1325A  ISSN： 1525-7797  CODEN： BOMAF6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エオシン-5-イソチオシアナート(EITC)/5-[3-アミノアリル]-2′-デオキシウリジン-5′-三燐酸Na塩(AA-dUTP)の反応により光開始剤標識化ヌクレオチド(EITC-dUTP)を合成した。複数種のキャプチャープローブ(A,B)を共有結合させたガラス板をターゲットAオリゴヌクレオチド(遺伝子成分DNA)を含む緩衝液中で熟成させることでプローブAのみとターゲットAをハイブリッド化させDNAマイクロアレイ(バイオチップ=BC)を作製した。DNAポリメラーゼによりBCにEITC-dUTPを共有結合させた。このBC上でアクリルアミド(AAm)を主成分とする混合物を光橋かけ共重合させることでプローブA/ターゲットAハイブリッド体からのみPAAmブラシ鎖を成長させた。これにより溶液中に存在したターゲットAから可視化可能なPAAmフィルム(I)を生成させることに成功した。すなわちIを染色後にスキャナーによりIの画像を得た。このPAAmフィルムの厚味がターゲットAの動的検出範囲(約2桁の濃度範囲)を示すことことが分かった。

シソーラス用語： 光開始剤 ,  ヌクレオチド ,  *分子ハイブリダイゼーション ,  定量分析 ,  標識化合物 ,  閾値 ,  濃度依存性 ,  DNAプローブ ,  バイオチップ ,  光重合 ,  架橋重合 ,  DNAマイクロアレイ ,  分子認識 ,  *高分子間反応 ,  高分子ブラシ ,  膜厚 ,  *高分子薄膜 ,  オリゴヌクレオチド ,  可視化 ,  生体高分子 ,  医用高分子 ,  DNAポリメラーゼ ,  脂肪族アルコール ,  無機酸エステル ,  脂肪族カルボン酸 ,  カルボアミド ,  ビニル化合物 ,  不飽和カルボン酸 ,  カルボン酸塩 ,  ヒドロキシ酸 ,  ポリカルボン酸
準シソーラス用語： 画像化 ,  *核酸ハイブリッド化

分類 (2件)： その他の高分子の反応  (CG03040H) ,  核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (8件)： 1-ビニル-2-ピロリジノン ,  SDS ,  アクリルアミド ,  くえん酸ナトリウム ,  メチルジエタノールアミン ,  5-イソチオシアナト-2′,4′,5′,7′-テトラブロモ-3′,6′-ビス(ソジオオキシ)スピロ[イソベンゾフラン-1(3H),9′-[9H]キサンテン]-3-オン ,  5-(3-アミノ-1-プロペニル)-2′-デオキシウリジン ,  5-[3-[3-[3-カルボキシ-4-(2,4,5,7-テトラブロモ-6-ヒドロキシ-3-オキソ-3H-キサンテン-9-イル)フェニル]チオウレイド]-1-プロペニル]-2′-デオキシウリジン5′-三りん酸

タイトルに関連する用語 (4件)： 核酸ハイブリッド化 ,  定量 ,  光開始剤 ,  ヌクレオチド