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J-GLOBAL ID：201002252846034295   整理番号：10A0605488

プロテオミクスプロフィル解析及びバイオマーカ発見のためのULDAベースの発見特徴選択法

ULDA-based heuristic feature selection method for proteomic profile analysis and biomarker discovery

著者 (4件)： ZHANG Mingjin (Key Lab. for Advanced Materials and Res. Centre of Analysis Test, 130 Meilong Rd Shanghai 200237, CHN) ,  ZHANG Mingjin (Dep. of chemistry, Qinghai normal university, Xining, 810008, CHN) ,  WANG Wenming (Key Lab. for Advanced Materials and Res. Centre of Analysis Test, 130 Meilong Rd Shanghai 200237, CHN) ,  DU Yiping (Key Lab. for Advanced Materials and Res. Centre of Analysis Test, 130 Meilong Rd Shanghai 200237, CHN)
資料名： Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems  (Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems)
巻： 102  号： 2  ページ： 84-90  発行年： 2010年07月15日 
JST資料番号： E0150B  ISSN： 0169-7439  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 無相関線形判別分析(ULDA)ベースの発見特徴選択(ULDA-HFS)法を,SELDI-TOF MS卵巣がんデータに対して試料分類及び特徴抽出について提案した。ULDA-HFS法は4段階,すなわち,1)ノイズ低減と正規化,2)CHI2法による分類ビンの選択,3)各選択ビンのピーク検出と配列,並びに4)ULDAによる潜在的バイオマーカのとしての数種のピークの選択,を含む。結果として,7m/z所在を本研究において選択し,それらは245.3,559.4,565.6,704.2,717.2,2667及び4074.4である。分類痕跡を評定するために,PCA,PLS-DA及びULDAを完全分離を得るために分類解析及びULDAに対して実行した。最後に,7選択潜在的バイオマーカをULDAにより評定して,感度及び特徴化両方とも100%である。得られた7m/z値は卵巣がんバイオマーカ発見の鍵を提供する。それらのm/z所在で蛋白質を一度同定すると,卵巣がんの初期検出と診断のための特殊蛋白質として用い得る。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *解析 ,  *バイオマーカー ,  *特徴選択 ,  特徴抽出 ,  *判別分析 ,  レーザ脱離質量分析 ,  *卵巣腫瘍 ,  *診断
準シソーラス用語： TOF-MS ,  *プロテオミクス解析 ,  線形判別分析 ,  *卵巣癌

分類 (3件)： 女性生殖器と胎児の腫よう  (GS04000K) ,  バイオアッセイ  (EA03060N) ,  分析化学一般  (CC02010H)

タイトルに関連する用語 (4件)： 解析 ,  バイオマーカ ,  発見 ,  特徴選択