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J-GLOBAL ID：201002255574446687   整理番号：10A0448140

マトリックス支援レーザ脱離イオン化飛行時間型質量分析及びトップダウンプロテオミクスによるEscherichia coli O157:H7蛋白質バイオマーカーの迅速な同定

Rapid Identification of Protein Biomarkers of Escherichia coli O157:H7 by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization-Time-of-Flight-Time-of-Flight Mass Spectrometry and Top-Down Proteomics

著者 (10件)： FAGERQUIST Clifton K. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  GARBUS Brandon R. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  MILLER William G. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  WILLIAMS Katherine E. (Univ. California, California) ,  YEE Emma (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  BATES Anna H. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  BOYLE Siobhan (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  HARDEN Leslie A. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  COOLEY Michael B. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California) ,  MANDRELL Robert E. (Agricultural Res. Serv., U.S. Dep. of Agriculture, California)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 82  号： 7  ページ： 2717-2725  発行年： 2010年04月01日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 自家開発のウェブベースソフトウェアを用いるマトリックス支援レーザ脱離イオン化飛行時間型質量分析(MALDI-TOF-TOF-MS/MS)及びトップダウンプロテオミクスによって2種の病原性大腸菌種O157:H7と非病原性大腸菌種非O157:H7から蛋白質バイオマーカー6種を同定した。同定した蛋白質バイオマーカーは酸ストレスチャペロン様蛋白質HdeA及びHdeB,寒冷ショック蛋白質CspC,ホメオボックス蛋白質YbgS,推定ストレス蛋白質YjbJと未知機能の蛋白質YahOである。蛋白質6種の内,4種は翻訳後修飾され,N末端シグナルペプチドが除去されていた。大腸菌種O157:H7と055:H7は密接な分類学的関係にあり,その結果,このバイオマーカー6種はO157:H7をO55:H7から区別するのには不充分であるが,YahO及びYbgSのトップダウンプロテオミクスによってO157:H2を非病原性大腸菌種から区別することは可能である。トップダウンプロテオミクスによって,非O157:H7菌種に存在するが,O157:H7菌種のスペクトルには存在しない蛋白質バイオマーカーが酸ストレスチャペロン様蛋白質HdeBであることを確認した。

シソーラス用語： *バイオマーカー ,  *タンパク質 ,  *大腸菌 ,  *MALDI-TOF MS ,  *プロテオミクス ,  タンデム質量分析 ,  定性分析 ,  病原性大腸菌 ,  シャペロンタンパク質 ,  ストレス ,  ストレスタンパク質 ,  核構成タンパク質 ,  転写因子 ,  翻訳後修飾 ,  フラグメンテーション ,  ヌクレオチド配列 ,  質量スペクトル ,  データ解析 ,  ソフトウェア ,  アルゴリズム ,  *飛行時間法
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  寒冷ショック蛋白質 ,  細菌培養 ,  酸ストレス ,  *大腸菌O157:H7

分類 (5件)： 生体物質一般  (EB02010G) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  質量分析  (CC03013N) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

タイトルに関連する用語 (15件)： マトリックス ,  支援 ,  レーザ ,  脱離 ,  イオン化 ,  飛行時間 ,  質量分析 ,  トップダウン ,  プロテオミクス ,  Escherichia ,  O157 ,  H7 ,  蛋白質 ,  バイオマーカー ,  同定