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J-GLOBAL ID：201002255757893909   整理番号：10A0684167

集団シーケンシングに基づく超高密度連鎖地図構築のための親非依存性の遺伝子型同定

Parent-independent genotyping for constructing an ultrahigh-density linkage map based on population sequencing

著者 (9件)： XIE Weibo (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  FENG Qi (Shanghai Inst. Biological Sci., Chinese Acad. Sci., Shanghai, CHN) ,  YU Huihui (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  HUANG Xuehui (Shanghai Inst. Biological Sci., Chinese Acad. Sci., Shanghai, CHN) ,  ZHAO Qiang (Shanghai Inst. Biological Sci., Chinese Acad. Sci., Shanghai, CHN) ,  XING Yongzhong (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  YU Sibin (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN) ,  HAN Bin (Shanghai Inst. Biological Sci., Chinese Acad. Sci., Shanghai, CHN) ,  ZHANG Qifa (Huazhong Agricultural Univ., Wuhan, CHN)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 23  ページ： 10578-10583  発行年： 2010年06月08日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 集団の非常に低い適用範囲のシーケンシングに基づく地図化集団の遺伝子型同定に対する親非依存性戦略を開発した。この戦略を用いて,2つの未シーケンスのイネの変種間の交配に由来する組換え自殖系統集団の低適用範囲シーケンシングでの高品質SNPからなる超高密度連鎖地図を構築した。この地図の正確性を,イネ粒子幅に対して以前にクローニングされた量的形質遺伝子座のイネGW5遺伝子を含む200kbのビンへの局在化で確認した。この戦略は,種々の地図化集団の遺伝子型同定に一般的に適用可能であった。

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  遺伝子型 ,  *連鎖地図 ,  一塩基多型 ,  イネ ,  量的形質遺伝子座 ,  遺伝子
準シソーラス用語： GW5遺伝子 ,  SNP

分類 (1件)： 遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 集団 ,  高密度 ,  連鎖地図 ,  構築 ,  非依存性 ,  遺伝子型 ,  同定