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J-GLOBAL ID：201002257870144869   整理番号：10A0092741

古倍数体ダイズのゲノム塩基配列

Genome sequence of the palaeopolyploid soybean

著者 (40件)： SCHMUTZ Jeremy (HudsonAlpha Genome Sequencing Center, Alabama, USA) ,  SCHMUTZ Jeremy (Joint Genome Inst., California, USA) ,  CANNON Steven B. (ARS, USDA, Iowa, USA) ,  SCHLUETER Jessica (Univ. North Carolina at Charlotte, North Carolina, USA) ,  SCHLUETER Jessica (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  MA Jianxin (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  MITROS Therese (Univ. California, California, USA) ,  NELSON William (Univ. Arizona, Arizona, USA) ,  HYTEN David L. (ARS, USDA, Maryland, USA) ,  SONG Qijian (ARS, USDA, Maryland, USA) ,  SONG Qijian (Univ. Maryland, Maryland, USA) ,  THELEN Jay J. (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  CHENG Jianlin (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  XU Dong (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  HELLSTEN Uffe (Joint Genome Inst., California, USA) ,  MAY Gregory D. (National Center for Genome Resources, New Mexico, USA) ,  YU Yeisoo (Univ. Arizona, Arizona, USA) ,  SAKURAI Tetsuya (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  UMEZAWA Taishi (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BHATTACHARYYA Madan K. (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  SANDHU Devinder (Univ. Wisconsin-Stevens Point, Wisconsin, USA) ,  VALLIYODAN Babu (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  LINDQUIST Erika (Joint Genome Inst., California, USA) ,  PETO Myron (ARS, USDA, Iowa, USA) ,  GRANT David (ARS, USDA, Iowa, USA) ,  SHU Shengqiang (Joint Genome Inst., California, USA) ,  GOODSTEIN David (Joint Genome Inst., California, USA) ,  BARRY Kerrie (Joint Genome Inst., California, USA) ,  FUTRELL-GRIGGS Montona (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  ABERNATHY Brian (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  DU Jianchang (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  TIAN Zhixi (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  ZHU Liucun (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  GILL Navdeep (Purdue Univ., Indiana, USA) ,  JOSHI Trupti (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  LIBAULT Marc (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  SETHURAMAN Anand (HudsonAlpha Genome Sequencing Center, Alabama, USA) ,  ZHANG Xue-Cheng (Univ. Missouri, Missouri, USA) ,  SHINOZAKI Kazuo (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  NGUYEN Henry T. (Univ. Missouri, Missouri, USA)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 463  号： 7278  ページ： 178-183  発行年： 2010年01月14日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ダイズ(Glycine max)は,種子にタンパク質や油を多く含み,土壌微生物との共生による大気窒素固定能力をもつことから,最も重要な農作物の1つとなっている。今回我々は,その1.1ギガ塩基のゲノム塩基配列を全ゲノム・ショットガン法を用いて解読し,物理的地図,高密度遺伝子地図と合わせて,染色体規模の概要塩基配列を作製した。タンパク質コード遺伝子は46,430個と推定され,シロイヌナズナよりは70%多く,同じく古倍数体(palaeopolyploid)であるポプラゲノムとは同程度である。推定遺伝子の約78%が染色体末端側領域にあり,これらの末端側領域はゲノム全体の2分の1以下だが,遺伝的組み換えのほぼすべてにこの領域がかかわっている。およそ5,900万年前と1,300万年前にゲノムの重複が起こっており,その結果,遺伝子の75%近くが複数のコピーをもつ非常に重複の多いゲノムとなっている。この2回の重複の後に,遺伝子の多様化と喪失,数多くの染色体再編成が起こっている。ダイズゲノムの正確な塩基配列によって,ダイズのさまざまな形質の遺伝的基盤の解明が容易になり,ダイズ改良品種の開発が促進されるだろう。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *ダイズ ,  ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  遺伝子 ,  コピー数 ,  倍数体 ,  遺伝子地図 ,  育種 ,  遺伝子重複
準シソーラス用語： *Glycine max ,  品種改良

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  豆類  (FC03035U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 倍数体 ,  ダイズ ,  ゲノム ,  塩基配列