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J-GLOBAL ID：201002258088627318   整理番号：10A0151550

畑土壌におけるphytostimulatory PGPR接種Azospirillum lipoferum CRT1のPCR検出のための16S-23S rDNA内部スペーサーの適用性

Applicability of the 16S-23S rDNA internal spacer for PCR detection of the phytostimulatory PGPR inoculant Azospirillum lipoferum CRT1 in field soil

著者 (7件)： BAUDOIN E. (IRD, Montpellier, FRA) ,  BAUDOIN E. ,  COUILLEROT O. ,  SPAEPEN S. ,  SPAEPEN S. (K.U. Leuven, Heverlee, BEL) ,  MOEENNE-LOCCOZ Y. ,  NAZARET S.
資料名： Journal of Applied Microbiology  (Journal of Applied Microbiology)
巻： 108  号： 1  ページ： 25-38  発行年： 2010年01月 
JST資料番号： A0635A  ISSN： 1364-5072  CODEN： JAMIFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 畑地土壌から植物成長促進根粒菌(PGPR)を接種したAzospirillum lipoferum CRT1をPCR検出するための標的としての16S-23S rDNA内部スペーサー領域(ISR)の適用性について調べた。Azospirillum属を標的としたプライマーfAZO/rAZOを用いた場合には,土壌中の土着のAzospirillum属群の識別には不適であった。一方A.lipoferum CRT1株を標的としたfCRT1/rCRT1は,A.brasilense Sp245株にはない単一の249-bpのPCR産物を生じた。野外の土壌から得たさまざまなDNA抽出物を用いてこれらのプライマーの適用性を試験した。その結果,16S-23S rDNA配列を標的としたPCRプライマーが,野外の土壌中に接種したA.lipoferum CRT1を適格に識別できることが判明した。

シソーラス用語： *Azospirillum ,  *畑地土 ,  PCR法 ,  植物成長 ,  成長促進 ,  *プライマー【遺伝】 ,  DNA【核酸】
準シソーラス用語： *Azospirillum lipoferum ,  根粒菌 ,  遺伝子間領域

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  植物の栽培一般  (FC01000S) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 畑土壌 ,  PGPR ,  接種 ,  Azospirillum ,  PCR検出 ,  rDNA ,  スペーサー ,  適用性