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J-GLOBAL ID：201002261762379245   整理番号：10A0755157

ヌクレオソームの配置とDNAメチル化との関係

Relationship between nucleosome positioning and DNA methylation

著者 (19件)： CHODAVARAPU Ramakrishna K. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  FENG Suhua (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  BERNATAVICHUTE Yana V. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  CHEN Pao-Yang (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  STROUD Hume (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  HETZEL Jonathan A. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  KUO Frank (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  KIM Jin (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  COKUS Shawn J. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  CASERO David (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  CLARK Amander T. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  JACOBSEN Steven E. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  PELLEGRINI Matteo (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  MERCHANT Sabeeha S. (Univ. California Los Angeles, California, USA) ,  YU Yanchun (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  ZHANG Xiaoyu (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  BERNAL Maria (Univ. Heidelberg, Heidelberg, DEU) ,  KRAEMER Ute (Univ. Heidelberg, Heidelberg, DEU) ,  HUIJSER Peter (Max Planck Inst. for Plant Breeding Res., Cologne, DEU)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 466  号： 7304  ページ： 388-392  発行年： 2010年07月15日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヌクレオソームは核内でDNAを小さくまとめて,DNAへの接近を調節しており,ヒストン八量体の周りにほぼ147塩基対の長さのDNAが巻き付いた構造をしている。今回我々は,シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)の単一ヌクレオソームの大量並行シーケンシング法による解読を使って,ゲノム全体でのヌクレオソームの配置を解析した。一塩基の分解能でのDNAメチル化プロファイルとこれらのデータを組み合わせることによって,ヌクレオソームに結合したDNAのメチル化状態に10塩基の周期性があることが突き止められ,ヌクレオソームDNAが周辺のDNAに比べて高度にメチル化されていることが明らかになった。これらの結果は,ヌクレオソームの配置がゲノム全域でのDNAメチル化パターンに影響すること,またDNAメチルトランスフェラーゼがヌクレオソームに結合したDNAを選択的に標的とすることを示している。同様の傾向がヒトのヌクレオソームDNAでも観察され,これはヌクレオソームとDNAメチルトランスフェラーゼの関係が保存されていることを示している。さらに,動物ではこれまでにも観察されているが,ヌクレオソームはエキソンに非常に多く,イントロン-エキソン,エキソン-イントロンの境界に選択的に配置されていた。RNAポリメラーゼII(Pol II)もイントロンに比べてエキソンに多く集まっており,ヌクレオソームの配置がPol IIの処理能力を調節しているという仮説が裏付けられた。DNAメチル化もエキソンに多くみられ,これはDNAメチル化がヌクレオソームに集中的に起こる傾向と一致しており,DNAメチル化はエキソン認識に役立っていると考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *ヌクレオソーム ,  メチル化 ,  Arabidopsis thaliana ,  ゲノム ,  DNAメチルトランスフェラーゼ ,  エキソン ,  イントロン ,  RNAポリメラーゼII ,  ヒト ,  分子認識 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  周期性

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (2件)： ヌクレオソーム ,  DNAメチル化