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J-GLOBAL ID：201002265760951761   整理番号：10A0163296

TrichOME 植物のトリコーム類のための比較オミックスデータベース

TrichOME: A Comparative Omics Database for Plant Trichomes

著者 (9件)： DAI Xinbin (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  WANG Guodong (Inst. Genetics and Dev. Biology, Chinese Acad. Sci., Beijing, CHN) ,  YANG Dong Sik (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  TANG Yuhong (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  BROUN Pierre (Nestle R&D Center Tours, Notre-Dame D’Oe, FRA) ,  MARKS M.David (Univ. Minnesota, Minnesota) ,  SUMNER Lloyd W. (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  DIXON Richard A. (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma) ,  ZHAO Patrick Xuechun (Samuel Roberts Noble Foundation, Oklahoma)
資料名： Plant Physiology  (Plant Physiology)
巻： 152  号： 1  ページ： 44-54  発行年： 2010年01月 
JST資料番号： C0606A  ISSN： 0032-0889  CODEN： PLPHA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物のトリコーム類は,化学物質の合成や分泌を行う能力を有する葉,花弁,茎,葉柄,花柄および種皮の表面に存在する表皮組織であるが,トリコーム特異的代謝経路や遺伝子類は,最近までほとんど知られておらず,利用可能なトリコームのゲノム情報も限られていた。植物のトリコーム研究を促進するために,統合的「オミックス」データベースである「TrichOME」を提供した。このデータベースは,EST/ユニジーン配列,トリコームと対照組織に由来するマイクロアレイハイブリダイゼイション,質量分析に基づくトリコーム代謝産物のプロフィル類,および公表文献からキュレートされたトリコーム関連遺伝子類を含む大量のデータベースを持っている。EST/ユニジーン配列は,他のデータベース類との配列類似性に基づいて注釈されたものであり,ユニジーン類,代謝産物類,キュレートされた遺伝子類,およびプローブ類は,比較解析が可能なようにマッピングされている。データベースはユニジーン類におけるトリコーム特異的遺伝子類およびマイクロアレイに基づく遺伝子発現プロフィル類の検索に焦点を当てたバイオ情報科学的ツールを総合化している。トリコームで発現する遺伝子類や代謝産物類は通常のcDNAライブラリーにはあまり発表されていないので,TrichOMEは植物のトリコーム研究のための価値あるユニークな資源であり,インターネットによって利用可能である。

シソーラス用語： *植物 ,  *植物組織 ,  比較 ,  生化学 ,  *データベース ,  遺伝子 ,  *代謝産物 ,  *遺伝子発現 ,  遺伝子ライブラリー ,  インターネット
準シソーラス用語： TrichOME ,  オミックス ,  *トリコーム

分類 (3件)： 物質の代謝  (EH02050Q) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  ドキュメンテーション  (JA01030X)

タイトルに関連する用語 (4件)： 植物 ,  トリコーム ,  オミックス ,  データベース