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J-GLOBAL ID：201002266155422893   整理番号：10A1075727

一定pH分子動力学シミュレーションはヒトプリオン蛋白質の高濃度β形を明らかにする

Constant-pH Molecular Dynamics Simulations Reveal a β-Rich Form of the Human Prion Protein

著者 (3件)： CAMPOS Sara R. R. (Universidade Nova de Lisboa, Oeiras, PRT) ,  MACHUQUEIRO Miguel (Universidade Nova de Lisboa, Oeiras, PRT) ,  BAPTISTA Antonio M. (Universidade Nova de Lisboa, Oeiras, PRT)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 114  号： 39  ページ： 12692-12700  発行年： 2010年10月07日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： プリオン蛋白質(PrP)の病因性高濃度β形(感染性スクレイピー形PrP^Sc)の誤折畳みは低pHがトリガーする細胞内経路で起こることが示唆されている。すなわち,「蛋白質単独仮説」に従うと,PrP^Scは唯一の感染剤であるPrP^Scの誤折畳み中の鋳型として働くことができる。ここでは,pH範囲2~7中合計して2μs以上でヒトPrP90~231の幾つかの一定pH分子動力学シミュレーションを行った。平均すると酸性pHに向かって螺旋含有量が減少し,β含有量が増加する立体配座の強いpH依存性を観察した。幾つかの提案したモデルと異なり,柔軟なN末端領域は低pHで安定構造を得ることができない。むしろ,主な構造変化は他のモデルで提案したように,すなわち135~155と185~200周辺領域にある高濃度ヘリックスC末端コア上で起こる。His187のプロトン化は二個のPrPサブドメイン間の相互作用損失と関連していることを見いだし,誤折畳み過程中で主要役割を演じる可能性がある。pH2のあるシミュレーションで,PrP^Sc生成の中間体である安定高濃度β構造が形成され,誤折畳みが二量化に先立つことを指示した。

シソーラス用語： *プリオンタンパク質 ,  ヒト ,  折畳み構造 ,  *アミロイドβタンパク質 ,  pH依存性 ,  スクレイピー因子 ,  アミノ酸残基 ,  アミノ酸配列 ,  *β構造 ,  含有量 ,  *二量化 ,  安定構造 ,  プロトン化 ,  濃度依存性 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  酸解離定数 ,  ヘリシティ ,  立体配座
準シソーラス用語： pKa ,  β蛋白質 ,  分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  神経系の疾患  (GN03000O)

タイトルに関連する用語 (6件)： pH ,  分子動力学シミュレーション ,  ヒト ,  プリオン蛋白質 ,  高濃度 ,  形