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J-GLOBAL ID：201002274204639570   整理番号：10A1114810

ペプチドのC^αD^α伸縮モードの構造依存性: ジペプチド構造における側鎖の影響

Conformation Dependence of the C^αD^α Stretch Mode in Peptides: Side-Chain Influence in Dipeptide Structures

著者 (2件)： MIRKIN Noemi G. (Univ. Michigan, MI) ,  KRIMM Samuel (Univ. Michigan, MI)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 93  号： 12  ページ： 1065-1071  発行年： 2010年12月 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 過去に理論的Alaペプチド研究から,C^α(折畳み)D^α(伸長)の伸縮振動であるv(CD)が2つのねじれ角φ(CNC^αC)とψ(NC^αCN)に敏感であることをab initio法で明らかにし,ペプチド構造決定への有用性を示した。また水和ペプチドの構造感受性増大が水分子との異なるC^α-D^α・・・O_Wの電気的/水素結合相互作用の形成に由来することも報告したが,蛋白質モデルジペプチドの側鎖が脂肪族(Gly,Ala,Val,Leu,Ile),極性(Ser)と芳香族(Phe)残基の場合のv(CD)に対する側鎖の影響を孤立および水和種について赤外-Raman分光とab initio MO法で評価し,異なった側鎖は孤立/水和ジペプチド双方の構造感受性C^αD^α伸縮振動に対して最小の影響しか与えないことを全ての脂肪族,極性と芳香族側鎖に対して証明した。ペプチド構造研究と設計における本事象の有用性が期待される。

シソーラス用語： 分子動力学 ,  ab initio MO法 ,  *ジペプチド ,  モデル化合物 ,  折畳み構造 ,  水和 ,  側鎖 ,  アミノ酸配列 ,  Raman分光法 ,  立体配座

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： ペプチド ,  伸縮 ,  構造依存性 ,  ジペプチド ,  側鎖