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J-GLOBAL ID：201002274350477565   整理番号：10A0729825

ペアワイズ作動物質スキャン法で組み合わせ刺激に対する細胞シグナル伝達応答を予測する

Pairwise agonist scanning predicts cellular signaling responses to combinatorial stimuli

著者 (4件)： CHATTERJEE Manash S (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  DIAMOND Scott L (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  PURVIS Jeremy E (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA) ,  BRASS Lawrence F (Univ. Pennsylvania, Pennsylvania, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 28  号： 7  ページ： 727-732  発行年： 2010年07月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 複数の刺激に対する細胞応答の予測は,患者特異的な臨床状態の評価,および細胞生物学の基本的な理解のために重要である。シグナル伝達経路間のクロストークは,個々の経路を単独で調べても予測することができず,ともに作用する複数の作動物質の組み合わせの複雑度のため実験空間全体を網羅的に検討することは不可能である。本論文では,ペアワイズ作動物質スキャン法(PAS)を紹介する。これは,個々の入力シグナル,および入力シグナルのあらゆるペアワイズ組み合わせに対する細胞応答の測定結果に基づいて神経ネットワークモデルを訓練する方法である。我々は,3種類の濃度(0.1,1,10×EC₅₀)の6種類の作動物質(ADP,コンブルキシン,U46619,SFLLRN,AYPGKF,PGE₂)に対するEDTA処理血漿中ヒト血小板のカルシウムシグナル伝達応答の予測にPASを応用した。モデルから,順次添加した作動物質,3種類の作動物質の組み合わせ,4~6種類の作動物質の45通りの組み合わせに対する応答が予測された(R=0.88)。さらに,ドナー10例の血小板の表現型応答がPASで識別された。神経ネットワークを用量応答範囲にわたって対刺激で訓練することは,患者特異的な疾患環境の複雑なシグナル統合を予測する効率的な手段となる。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *細胞情報伝達 ,  ペプチド ,  アミノ酸配列 ,  ヒト ,  血小板 ,  用量作用相関 ,  *数値予測 ,  薬物療法 ,  併用療法 ,  *併用効果 ,  薬物 ,  蛇毒 ,  プロスタグランジン受容体 ,  タンパク質 ,  ホルモン受容体 ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド ,  ジエン ,  不飽和アルコール ,  不飽和カルボン酸 ,  脂環式アルコール ,  脂環式ケトン ,  ジオール ,  ヒドロキシケトン ,  酸素複素環化合物 ,  架橋化合物 ,  プロスタグランジン
準シソーラス用語： AYPGKF ,  EP1 ,  EP2 ,  EP3 ,  EP4 ,  SFLLRN ,  アゴニスト ,  *カルシウムシグナル伝達応答 ,  クロストーク【生体】 ,  コンブルキシン ,  *シグナル伝達経路 ,  *細胞応答 ,  *神経ネットワーク ,  *神経ネットワークモデル ,  ペアワイズアゴニストスキャン法

分類 (4件)： 血液検査  (GC02050D) ,  臨床診断学  (GC03003G) ,  薬理学一般  (GW01000B) ,  数値計算  (JE02000J)

物質索引 (3件)： ADP ,  PGE₂ ,  U-46619

タイトルに関連する用語 (8件)： 物質 ,  スキャン法 ,  組み合わせ ,  刺激 ,  細胞 ,  シグナル伝達 ,  応答 ,  予測