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J-GLOBAL ID：201002274677959504   整理番号：10A0135517

密度汎関数法による水和したDNAの電子状態解析: DNA副溝内の水和水がHOMOに与える影響

Density Functional MO Study on Hydrated Duplex DNA: Effect of Water Molecules on HOMO Distribution of DNA

著者 (7件)： 塚本貴志 (豊橋技術科学大学,知識情報工学系) ,  塚本貴志 (Dep. of Chemistry, Univ. of Puerto Rico) ,  ISHIKAWA Yasuyuki (Dep. of Chemistry, Univ. of Puerto Rico) ,  夏目貴行 (豊橋技術科学大学,知識情報工学系) ,  出立兼一 (豊橋技術科学大学,知識情報工学系) ,  VILKAS Marius J (Dep. of Chemistry, Univ. of Puerto Rico) ,  栗田典之 (豊橋技術科学大学,知識情報工学系)
資料名： Journal of Computer Aided Chemistry (Web)  (Journal of Computer Aided Chemistry (Web))
巻： 7  ページ： 190-200 (J-STAGE)  発行年： 2006年 
JST資料番号： U0067A  ISSN： 1345-8647  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 本研究では、DNAへの水和がDNAの電子状態、特に、DNA中の電荷移動に関係するフロンティア分子軌道の空間分布にどのような影響を与えるかを明らかにする目的で、中性子回折により得られた水和水を含むB型DNAに対し、密度汎関数法に基づくAb initio 分子軌道(MO)計算を行った。その結果、DNAの副溝内に水素結合する水分子に、ホール移動に関係するHOMO周辺のMOが分布することを明らかにした。従って、DNAの副溝への水分子の水素結合により、DNA中のホール移動の経路が変化する可能性がある。(著者抄録)

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  水和 ,  *結合水 ,  *電子状態 ,  *溝 ,  *密度汎関数法 ,  *HOMO ,  電荷移動 ,  正孔 ,  輸送現象 ,  分子軌道計算 ,  空間分布 ,  中性子回折 ,  水素結合 ,  経路 ,  精度 ,  対イオン ,  構造最適化 ,  *B-DNA
準シソーラス用語： 計算精度 ,  *水和水 ,  正孔輸送 ,  *副溝【DNA】

分類 (2件)： ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

引用文献 (30件)：

• M. Chee, R. Yang, E. Hubbell, A. Berno, X.C. Huang, D. Stern, J. Winkler, D.J. Lockhart, M.S. Morris, S.P. Fodor, Science, 274, 610, (1996).
• Y.S. Choi, D.H. Park, J. Korean Phys. Soc., 44, 1556, (2004).
• 石森義雄, 表面科学, 24, 671, (2003).
• H. Y. Lee, H. Tanaka, Y. Otsuka, K. H. Yoo, J. O. Lee, T. Kawai, Appl. Phys. Lett., 80, 1670, (2002).
• R. D. Ari, R. Thomas, C. R. Biologies, 326, 215, (2003).

タイトルに関連する用語 (8件)： 密度汎関数法 ,  水和 ,  DNA ,  電子状態 ,  解析 ,  副溝 ,  水和水 ,  HOMO