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J-GLOBAL ID：201002280084310617   整理番号：10A1375782

古細菌Lsm蛋白質はスモールRNAに結合する

The Archaeal Lsm Protein Binds to Small RNAs

著者 (13件)： FISCHER Susan (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  BENZ Juliane (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  SPAETH Bettina (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  MAIER Lisa-Katharina (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  STRAUB Julia (Goethe-Univ., Frankfurt, DEU) ,  GRANZOW Michaela (Goethe-Univ., Frankfurt, DEU) ,  RAABE Monika (Max-Planck-Inst. Biophysical Chemistry, Goettingen, DEU) ,  URLAUB Henning (Max-Planck-Inst. Biophysical Chemistry, Goettingen, DEU) ,  HOFFMANN Jan (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  BRUTSCHY Bernd (Ulm Univ., Ulm, DEU) ,  ALLERS Thorsten (Univ. Nottingham, Nottingham, GBR) ,  SOPPA Joerg (Goethe-Univ., Frankfurt, DEU) ,  MARCHFELDER Anita (Ulm Univ., Ulm, DEU)
資料名： Journal of Biological Chemistry  (Journal of Biological Chemistry)
巻： 285  号： 45  ページ： 34429-34438  発行年： 2010年11月05日 
JST資料番号： E0038A  ISSN： 0021-9258  CODEN： JBCHA3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 好塩性古細菌Haloferax volcaniiのSm様蛋白質LsmのRNA代謝における機能をin vitroおよびin vivo解析した。LsmのORFはリボソーム蛋白質のORFと重複し,そのアミノ酸配列はP.abyssi Lsmの構造のβシート2および3に対応する配列を除き,古細菌で高度に保存されていた。好気的増殖時,転写体レベルは初期対数期から定常期まで変化せず,低塩(1.5M NaCl),高塩(3M NaCl),高温(48°C)での増殖時同一であった。二シストロン性及び一シストロン性転写体は低温(30°C)および硝酸呼吸増殖時検出されなかった。組換蛋白質はホモ七量体で,sRNAsおよびsnoRNAsと相互作用し,系統発生的に保存性が高く,真核性スプライシング関連蛋白質の良いモデルとなった。

シソーラス用語： 細菌タンパク質 ,  Halobacteriaceae ,  古細菌 ,  リボソームタンパク質 ,  *RNA結合タンパク質 ,  アミノ酸配列 ,  相同性 ,  *snRNA ,  *スプライシング因子
準シソーラス用語： Haloferax volcanii ,  *Lsm蛋白質 ,  *snoRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 古細菌 ,  LSM ,  蛋白質 ,  スモールRNA