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J-GLOBAL ID：201002280464580099   整理番号：10A0889610

肉牛の発情期の遺伝的解剖のための関連重み行列

Association weight matrix for the genetic dissection of puberty in beef cattle

著者 (19件)： FORTES Marina R. S. (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  FORTES Marina R. S. (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  FORTES Marina R. S. (Univ. Queensland, QLD, AUS) ,  REVERTER Antonio (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  REVERTER Antonio (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  ZHANG Yuandan (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  ZHANG Yuandan (Univ. New England, NSW, AUS) ,  COLLIS Eliza (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  COLLIS Eliza (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  NAGARAJ Shivashankar H. (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  JONSSON Nick N. (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  JONSSON Nick N. (Univ. Queensland, QLD, AUS) ,  JONSSON Nick N. (Univ. Glasgow, Glasgow, GBR) ,  PRAYAGA Kishore C. (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  PRAYAGA Kishore C. (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  BARRIS Wes (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  BARRIS Wes (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS) ,  HAWKEN Rachel J. (Cooperative Res. Centre for Beef Genetic Technol.) ,  HAWKEN Rachel J. (Commonwealth Scientific and Industrial Res. Organization, QLD, AUS)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 31  ページ： 13642-13647  発行年： 2010年08月03日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムワイドな関連の結果に遺伝子ネットワーク理論を適用した複雑な特性に関するシステムバイオロジー的アプローチについて述べる。生物の複雑な特性を一つか二つの形質の測定で行うには限界があるが,複数の形質を導入する方法が十分確立されているわけではない。我々は発情期の年齢に連関する一塩基多型(SNP)を22個の連関する特性と関連づけることを行った。その結果,関連重み行列(AWM)が遺伝子を各列に,特性を各行に配置して得られた。AWMの行に関する解析では血統に制限された最尤法により遺伝的な関連が推定され,列に関する解析では階層的クラスタ解析,遺伝子ネットワークおよび経路解析を組み合わせて通常のゲノムワイド解析では見逃してきた遺伝的なドライバーを発見した。さらに,AWMで予想された重要な転写調節因子の標的となるプロモーター領域を調べ,これらの因子の結合領域を調べた。このように,AWMは発情期の既知の生物学を再現でき,実験的に検証されている結合領域を取得可能で,次に解析すべき遺伝子や遺伝子相互作用の候補を同定できた。

シソーラス用語： *肉牛 ,  ゲノム ,  形質発現 ,  一塩基多型 ,  プロモーター領域 ,  転写因子 ,  思春期 ,  *行列 ,  最尤法 ,  遺伝学実験技術 ,  生物学 ,  重みづけ ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： SNP ,  システム生物学 ,  *関連重み行列 ,  発情期

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  牛  (FD02020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： 肉牛 ,  発情期 ,  解剖 ,  行列