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J-GLOBAL ID：201002281987227631   整理番号：10A0204118

変性高速液体クロマトグラフィーと正確な断片サイジングによる末端制限断片長多形性を用いた微生物集団構造と特性の分析

Coupling of Denaturing High-Performance Liquid Chromatography and Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism with Precise Fragment Sizing for Microbial Community Profiling and Characterization

著者 (6件)： PENNY Christian (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  NADALIG Thierry (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  ALIOUA Malek (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  GRUFFAZ Christelle (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  VUILLEUMIER Stephane (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA) ,  BRINGEL Francoise (Univ. de Strasbourg, Strasbourg, FRA)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 76  号： 3  ページ： 648-651  発行年： 2010年02月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 既知の細菌5株(Clostridium acetobutylicum ATCC824,Staphylococcus aureus ATCC25904,Methylobacterium extorquens CM4,Pseudomonas chlororaphis subsp.chlororaphis DSM 50083,P.stutzeri KC(DSM7136)よりのDNAの末端制限断片長多形性(T-RFLP)と変性高速液体クロマトグラフィー(D-HPLC)を組み合わせて使用し16S rRNA遺伝子分析を行い,微生物集団の特性を分析する方法を示した。第1回目のT-RFLP試行により断片長総数を分析し,第2回目のT-RFLP試行により50から500ヌクレオチドの正確な定量を行った。D-HPLCによって同じ鎖長のT-RFの識別を行った。この2方法によって15株の識別が可能である。

シソーラス用語： *細菌検査 ,  *RFLP ,  *高速液体クロマトグラフィー ,  rRNA遺伝子 ,  PCR法 ,  *遺伝子型 ,  生物分類 ,  Clostridium acetobutylicum ,  黄色ぶどう球菌 ,  Pseudomonas ,  ミクロフローラ
準シソーラス用語： T-RFLP ,  変性高速液体クロマトグラフィー ,  16S rRNA遺伝子 ,  Methylobacterium extorquens ,  Pseudomonas chlororaphis ,  Pseudomonas stutzeri

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 変性高速液体クロマトグラフィー ,  断片 ,  サイジング ,  制限断片長多形性 ,  微生物 ,  集団構造 ,  分析