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J-GLOBAL ID：201002283129338223   整理番号：10A0383842

複合組織の細胞型-特異遺伝子発現の相違

Cell type-specific gene expression differences in complex tissues

著者 (11件)： SHEN-ORR Shai S (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  TIBSHIRANI Robert (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  KHATRI Purvesh (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  BODIAN Dale L (Novartis Pharmaceuticals Corp, New Jersey, USA) ,  STAEDTLER Frank (Novartis Inst. BioMedical Res., Basel, CHE) ,  PERRY Nicholas M (Stanford Univ., California, USA) ,  HASTIE Trevor (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  SARWAL Minnie M (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  DAVIS Mark M (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA) ,  DAVIS Mark M (Stanford Univ., California, USA) ,  BUTTE Atul J (Stanford Univ. School of Medicine, California, USA)
資料名： Nature Methods  (Nature Methods)
巻： 7  号： 4  ページ： 287-289  発行年： 2010年04月 
JST資料番号： W1413A  ISSN： 1548-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生体試料各細胞型の遺伝子発現プロフィルを解析するcsSAMアルゴリズムを示した。遺伝子発現のマイクロアレイデータと各細胞型の相対的頻度を統計学的に処理して,細胞型特異発現プロフィルを取得した。最初に,csSAMは再構成細胞型混合物を用いて検証した。次に,腎臓移植後の急性移植拒絶と安定移植患者の白血球サブセットにおける遺伝子発現プロファイルを調べて,csSAMの有用性を実証した。

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  DNAマイクロアレイ ,  *遺伝学実験技術 ,  *計算機アルゴリズム ,  デコンボリューション ,  白血球 ,  腎臓移植 ,  *組織化学
準シソーラス用語： *細胞遺伝学的分析

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： 複合組織 ,  細胞型 ,  遺伝子発現 ,  相違