文献

J-GLOBAL ID：201002284081676136   整理番号：10A0589613

EvolvingSpace:生物情報科学アプリケーションを統合するためのデータ中心型フレームワーク

EvolvingSpace: A Data Centric Framework for Integrating Bioinformatics Applications

著者 (3件)： WANG Chen (CSIRO ICT Center, NSW, AUS) ,  ZHOU Bing Bing (Univ. Sydney, NSW, AUS) ,  ZOMAYA Albert Y. (Univ. Sydney, NSW, AUS)
資料名： IEEE Transactions on Computers  (IEEE Transactions on Computers)
巻： 59  号： 6  ページ： 721-734  発行年： 2010年06月 
JST資料番号： C0233A  ISSN： 0018-9340  CODEN： ICTOB4  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム配列や遺伝子発現プロファイリング技術の進歩は巨大なデータを生み出した。データの多くはそれらを分析するツールと同様に,相互関係を持つ。オンデマンドで不均一性なデータ・ツールを統合するのが望ましいが,異なる研究グループによるデータ生成,データ分析における計算・データ集約タスクの包含などの理由で困難である。統合およびスケーラビリティのニーズに応えるために,EvolvingSpaceを以下1)-4)にて提案した。1)システムモデル,2)分散実行エンジンとワークフロー構築メカニズム,3)データ局所性とワークフロー認識スケジューリングアルゴリズム,4)システム実装と性能評価。本システムは生物情報科学分野におけるデータアノテーションをデータエンティティ集合に汎化し,これらを蓄積・検索するための非集中型データ管理システムを可能にする。また,緩結合したPCシステムにおける分散アプリケーション実行エンジンを提供し,性能向上のためにスケジューリングアルゴリズムを使用する。実験の結果,EvolvingSpaceが複雑なアプリケーションを効率的に実行し,生物情報科学データセンターに適合することを示した。

シソーラス用語： 不均一性 ,  *情報科学 ,  *生物学 ,  情報蓄積 ,  *システムインテグレーション ,  データ解析 ,  データセンタ ,  データ探索 ,  スケーラビリティ【計算機】 ,  分散処理 ,  *データモデル ,  スケジューリング ,  アノテーション ,  ワークフロー ,  スループット
準シソーラス用語： 生物情報科学

分類 (1件)： データベースシステム  (JD03030U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 生物情報科学 ,  アプリケーション ,  統合 ,  フレームワーク