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J-GLOBAL ID：201002285659529120   整理番号：10A0106881

多重スケール分子動力学/秩序パラメータ外挿シミュレーションにより明らかにしたウイルス構造転移機構

Viral Structural Transition Mechanisms Revealed by Multiscale Molecular Dynamics/Order Parameter eXtrapolation Simulation

著者 (2件)： MIAO Yinglong (Indiana Univ., IN) ,  ORTOLEVA Peter J. (Indiana Univ., IN)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 93  号： 1  ページ： 61-73  発行年： 2010年01月 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ナノ系動力学の全原子多重スケール解析理論に基づいて最近開発された多重スケール分子動力学(MD)/秩序パラメータ外挿(Order Parameter eXtrapolation:OPX)法を最適化し,ウイルスカプシド構造転移のシミュレーションを行った。ササゲクロロティックモトルウイルスカプシドの膨潤状態をMD/OPXシミュレーションした結果,膨潤状態は真空中にて,著しいエネルギー-駆動収縮を示すことが分かった。カプシド収縮過程で,強い共役アロステリック相互作用を通してカプソマーは協同的に運動し,その結果,構造転移は局所的に開始し,ついで中間状態を経由してカプシド全体に伝播する対称-破壊過程であることを明らかにした。

シソーラス用語： *ブロモウイルス科 ,  *カプシド ,  *膨潤 ,  アロステリック効果 ,  結晶構造 ,  静電相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  膜構造 ,  ナノ構造 ,  秩序パラメータ ,  過程
準シソーラス用語： *ササゲクロロティックモトルウイルス ,  破壊過程 ,  分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 多重スケール ,  分子動力学 ,  秩序パラメータ ,  外挿 ,  シミュレーション ,  ウイルス ,  構造転移