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J-GLOBAL ID：201002285686106745   整理番号：10A0379110

スパイ分子として六フッ化硫黄を用いるNMRによる蛋白質の空洞を明らかにする

Highlighting Cavities in Proteins by NMR Using Sulfur Hexafluoride as a Spy Molecule

著者 (5件)： FUSARO Luca (Universita di Cagliari, Monserrato (CA), ITA) ,  FUSARO Luca (Univ. Libre de Bruxelles, Brussels, BEL) ,  LOCCI Emanuela (Universita di Cagliari, Monserrato (CA), ITA) ,  LAI Adolfo (Universita di Cagliari, Monserrato (CA), ITA) ,  LUHMER Michel (Univ. Libre de Bruxelles, Brussels, BEL)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 114  号： 9  ページ： 3398-3403  発行年： 2010年03月11日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 溶液状態NMR,特に¹H{¹⁹F}HOESY実験によって蛋白質の疎水性空洞を調べるため,六フッ化硫黄SiF₆の使用を報告した。調べた系はコムギ非特異的脂質輸送蛋白質(LTP)である。この90個の残基蛋白質は脂質分子(プロスタグランジンB2)を収容できる大きな疎水性空洞を含んで1:1複合体を形成する。¹⁹F化学シフト,スペクトル線幅または縦緩和時間測定によってSiF₆の結合を直接検出し,蛋白質の共鳴からの妨害なしに低SiF₆濃度でこれらを測定できた。最も興味深いことは,SiF₆結合が選択的分子間¹H{¹⁹F}異種核Overhauser効果(HOE)を生じる。分子動力学シミュレーションとNMRスペクトルモデリングは実測したHOESYスペクトルがLPTの空洞中のSiF₆から生じる¹H{¹⁹F}HOEと因果関係にあることを示す。SiF₆は溶液状態NMRによって蛋白質の空洞を検出するための過分極¹²⁹Xe及び有機小分子に対する有利な代替であることを見いだした。

シソーラス用語： *タンパク質 ,  コムギ ,  アミノ酸残基 ,  生体輸送 ,  空洞 ,  *タンパク質複合体 ,  プロスタグランジン ,  *フッ化硫黄 ,  化学シフト ,  スペクトル線幅 ,  スピン-格子緩和 ,  緩和時間 ,  *Overhauser効果 ,  濃度依存性 ,  計算機シミュレーション ,  分子動力学 ,  二次元NMR ,  陽子磁気共鳴 ,  フッ素19NMR ,  因果律
準シソーラス用語： 異種核二次元NMR ,  因果関係 ,  脂質輸送蛋白質 ,  縦緩和 ,  分子プローブ ,  分子動力学シミュレーション ,  六フッ化硫黄

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  有機化合物のNMR  (BM07044Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 分子 ,  フッ化硫黄 ,  NMR ,  蛋白質 ,  空洞