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J-GLOBAL ID：201002286338610762   整理番号：10A0826538

Brachypodium distachyonコミュニティ-スタンダード系統Bd21ゲノムにおける1000以上のT-DNAタグの分布と特徴づけ

Distribution and characterization of more than 1000 T-DNA tags in the genome of Brachypodium distachyon community standard line Bd21

著者 (5件)： THOLE Vera (Norwich Res. Park, Norwich, GBR) ,  WORLAND Barbara (Norwich Res. Park, Norwich, GBR) ,  WRIGHT Jonathan (Norwich Res. Park, Norwich, GBR) ,  BEVAN Michael W. (Norwich Res. Park, Norwich, GBR) ,  VAIN Philippe (Norwich Res. Park, Norwich, GBR)
資料名： Plant Biotechnology Journal  (Plant Biotechnology Journal)
巻： 8  号： 6  ページ： 734-747  発行年： 2010年08月 
JST資料番号： W1741A  ISSN： 1467-7644  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Brachypodium distachyonのコミュニティースタンダード系統Bd21の稔性T-DNA挿入系統の大規模生産と分析について報告する。本研究では,発現遺伝子を含む完全なT-DNA挿入断片と隣接配列タグ(FST)の回収を促進するため,抗生物質と緑色蛍光の二重選抜を用い,Bfalでdistachyonゲノムの制限分解後,アダプターライゲーションPCR法を用いてT-DNAの左右両側の隣接領域を分析した。一次トランスジェニック植物は,T-DNA系統資源として76%が使用可能であり,1系統あたり平均1.4FSTおよび0.9T-DNAの挿入が起こった。平均して,全ての二次稔性植物系統毎に1つの遺伝子が標識でき,3系統のうち1つが,コード配列内またはその周辺500bpにT-DNA挿入断片を含んでいた。標識された遺伝子の約60%が発現遺伝子に対応した。BrachyTAGプログラムにより作られたT-DNA系統は,コミュニティー資源として,BrachyTAG web siteで2008年から国際的に配布されている。

シソーラス用語： イネ科 ,  ヌクレオチド配列 ,  *T-DNA ,  遺伝学 ,  ゲノム ,  *DNAマーカー ,  遺伝資源
準シソーラス用語： Brachypodium distachyon ,  DNA標識 ,  FST ,  ゲノミクス ,  ミナトカモジグサ

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (8件)： Brachypodium ,  コミュニティ ,  スタンダード ,  系統 ,  ゲノム ,  T-DNA ,  タグ ,  分布