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J-GLOBAL ID：201002287292894953   整理番号：10A0988227

トランスに作用する遺伝子座により調節される抗ウイルス発現ネットワークおよび1型糖尿病リスク

A trans-acting locus regulates an anti-viral expression network and type 1 diabetes risk

著者 (40件)： HEINIG Matthias (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  BAUERFEIND Anja (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  HUMMEL Oliver (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  LEE Young-Ae (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  PASKAS Svetlana (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  RINTISCH Carola (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  SAAR Kathrin (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  SCHULZ Herbert (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  HUBNER Norbert (Max-Delbrueck-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, DEU) ,  HEINIG Matthias (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  ROIDER Helge G. (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  VINGRON Martin (Max Planck Inst. for Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  PETRETTO Enrico (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  BOTTOLO Leonardo (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  LU Han (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  LI Yoyo (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  SARWAR Rizwan (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  LANGLEY Sarah R. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  BUCHAN Rachel (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  AITMAN Timothy J. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  COOK Stuart A. (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  WALLACE Chris (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  COOPER Jason (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SMYTH Deborah J. (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  CLAYTON David (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  TODD John A. (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ROTIVAL Maxime (Pierre and Marie Curie Univ. (UPMC, Paris 6), Paris, FRA) ,  MAOUCHE Seraya (Pierre and Marie Curie Univ. (UPMC, Paris 6), Paris, FRA) ,  TIRET Laurence (Pierre and Marie Curie Univ. (UPMC, Paris 6), Paris, FRA) ,  CAMBIEN Francois (Pierre and Marie Curie Univ. (UPMC, Paris 6), Paris, FRA) ,  LEE Young-Ae (Charite-Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  GRAY Elizabeth E. (Univ. California San Francisco, California, USA) ,  CYSTER Jason G. (Univ. California San Francisco, California, USA) ,  ERDMANN Jeanette (Univ. zu Luebeck, Luebeck, DEU) ,  SCHUNKERT Heribert (Univ. zu Luebeck, Luebeck, DEU) ,  HENGSTENBERG Christian (Univ. Regensburg, Regensburg, DEU) ,  OUWEHAND Willem H. (Univ. Cambridge) ,  OUWEHAND Willem H. (National Health Serv. Blood and Transplant, Cambridge, GBR) ,  OUWEHAND Willem H. (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  RICE Catherine M. (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 467  号： 7314  ページ： 460-464  発行年： 2010年09月23日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子ネットワークとDNA塩基配列の差異の複合解析から,全ゲノム関連解析だけでは明らかになりにくい一般的な疾患の病因について,新たな手がかりを得ることができる。ラット・ゲノミクスにおける最近の進歩により,システム遺伝学的手法が進展している。今回我々は,統合された全ゲノム解析手法をラットの7種類の組織に対して使用することにより,遺伝子ネットワークおよびその調節の基本となる遺伝子座を同定したことを報告する。我々は以前に,ウイルス応答遺伝子に富むIDIN(interferon regulatory factor7[IRF7]-driven inflammatory network)を明らかにしており,これはマクロファージの分子バイオマーカーで,ラットの複数の組織で染色体15q25上に存在する1つの遺伝子座によって調節されていた。今回我々は,この遺伝子座に位置し,Bリンパ球の遊走を制御するEbi2(Epstein-Barr virus induced gene2;Gpr183としても知られる)が,マクロファージで発現し,IDINを調節していることを示す。この遺伝子座のヒトオルソログは染色体13q32にあり,ヒトでIDINに相当する遺伝子ネットワークを制御していて,このネットワークは単球内で進化的に保存されていた。IDIN遺伝子群は,無作為に選択した免疫応答遺伝子と比較して,マクロファージと関連する自己免疫疾患である1型糖尿病(T1D)に対する感受性との関連性がより高かった(P=8.85×10^-6)。ヒトでIDINを制御する遺伝子座は,一塩基多型rs9585056によるT1Dのリスクとの関連が認められたが(P=7.0×10^-10;オッズ比1.15),この一塩基多型は,この領域内においてEBI2(GPR183)発現と関連のある5つの一塩基多型のうちの1つであった。今回の結果は,T1Dの病因が,IRF7ネットワーク遺伝子群およびそれを調節する遺伝子座と密接な関係にあることを示している。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *遺伝子座 ,  危険因子 ,  マクロファージ ,  一塩基多型 ,  遺伝子 ,  ヒト ,  遺伝的調節 ,  ラット ,  *1型糖尿病
準シソーラス用語： *インシュリン依存性糖尿病 ,  Ebi2遺伝子 ,  *IDIN遺伝子座 ,  SNP

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： トランス ,  遺伝子座 ,  調節 ,  ウイルス ,  発現 ,  1型糖尿病 ,  リスク