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J-GLOBAL ID：201002289541625049   整理番号：10A1327862

RNA-seqデータのde novo組立と分析

De novo assembly and analysis of RNA-seq data

著者 (32件)： ROBERTSON Gordon (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  SCHEIN Jacqueline (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  CHIU Readman (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  CORBETT Richard (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  FIELD Matthew (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  JACKMAN Shaun D (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  MUNGALL Karen (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  LEE Sam (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  OKADA Hisanaga Mark (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  QIAN Jenny Q (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  GRIFFITH Malachi (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  RAYMOND Anthony (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  THIESSEN Nina (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  CEZARD Timothee (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  BUTTERFIELD Yaron S (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  NEWSOME Richard (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  CHAN Simon K (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  SHE Rong (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  VARHOL Richard (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  KAMOH Baljit (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  PRABHU Anna-Liisa (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  TAM Angela (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  ZHAO YongJun (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  MOORE Richard A (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  HIRST Martin (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  MARRA Marco A (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  MARRA Marco A (Univ. British Columbia, Vancouver, CAN) ,  JONES Steven J M (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  JONES Steven J M (Univ. British Columbia, Vancouver, CAN) ,  HOODLESS Pamela A (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN) ,  HOODLESS Pamela A (Univ. British Columbia, Vancouver, CAN) ,  BIROL Inanc (British Columbia Cancer Agency, Vancouver, CAN)
資料名： Nature Methods  (Nature Methods)
巻： 7  号： 11  ページ： 909-912  発行年： 2010年11月 
JST資料番号： W1413A  ISSN： 1548-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA-seqによる短リードトランスクリプトームデータを組み立てて,分析するTrans-ABySSについて述べた。マウス肝臓ポリ(A)RNAライブラリーの50塩基Illuminaペアエンド短リードの7.4ギガベースを分析した結果,Trans-ABySSは既知,新規に加えて代替構造転写産物を同定することができた。これらの結果は,Trans-ABySSが高感度で特異性であることを示した。

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,  *遺伝学実験技術 ,  マウス ,  肝臓 ,  RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： RNA-seq ,  *トランスクリプトーム解析 ,  ポリ(A)RNA ,  転写産物

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： RNA-seq ,  組立 ,  分析