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J-GLOBAL ID：201002290260142322   整理番号：10A0978737

超塩ショックDunaliella salinaにおける発現配列タグ(EST)プロファイリングは蛋白質合成装置成分の高い発現を明らかにする

Expressed sequence tag (EST) profiling in hyper saline shocked Dunaliella salina reveals high expression of protein synthetic apparatus components

著者 (6件)： ALKAYAL Fadi (Dasman Center for Res. and Treatment of Diabetes, P.O Box 1180, Dasman, Kuwait) ,  ALBION Rebecca L. (Dep. of Biochemistry & Molecular Biology, MS200, Univ. of Nevada, Reno, NV 89557-0200, USA) ,  TILLETT Richard L. (Dep. of Biochemistry & Molecular Biology, MS200, Univ. of Nevada, Reno, NV 89557-0200, USA) ,  HATHWAIK Leyla T. (Dep. of Biochemistry & Molecular Biology, MS200, Univ. of Nevada, Reno, NV 89557-0200, USA) ,  LEMOS Mark S. (Dep. of Biochemistry & Molecular Biology, MS200, Univ. of Nevada, Reno, NV 89557-0200, USA) ,  CUSHMAN John C. (Dep. of Biochemistry & Molecular Biology, MS200, Univ. of Nevada, Reno, NV 89557-0200, USA)
資料名： Plant Science  (Plant Science)
巻： 179  号： 5  ページ： 437-449  発行年： 2010年11月 
JST資料番号： C0945B  ISSN： 0168-9452  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アイルランド (IRL)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単細胞性,塩抵抗性緑藻Dunaliella salina(Chlorophyceae緑藻綱)は,約0.05から5.5mMの広い範囲の塩条件下に適応し,生育する特異能力を有する。この塩抵抗性の分子基盤を理解するため,2.5M NaClに適応し,3.4M NaCl5時間塩ショック下D.salina細胞から相補性DNA(cDNA)ライブラリーを構築し,発現配列タグ(EST)データベース生成に用いた。ESTsは1401の特異転写体を示す2831クローンに対して得られた。蛋白質データベースとの比較で,推定機能を1901(67.2%)ESTsに対して指定した。更に154(5.4%)ESTsはその機能が不明確な既知配列に類似性を有し,776(27.4%)は既知配列に類似性を有していなかった。機能性指定が出来たD.salina ESTsに対し,最も大きいカテゴリーは蛋白質合成(35.7%),エネルギー(光合成)(21.4%),一次代謝(13.8%)及び蛋白質運命(6.8%)を含んだ。蛋白質合成カテゴリー内で,ESTsの大部分(80.3%)はサイトゾル性リボソームの約82サブユニットの約95%を表すリボソーム蛋白質をコードし,D.salinaはかなりの資源を蛋白質合成産生及び維持に投資していることを示唆した。塩ショックで増加するmRNA発現は,小数の選択遺伝子セットに対し,実時間定量的逆転写ポリメラーゼ鎖反応(qRT-PCR)により証明した。このESTコレクションはまたD.salinaの対して以前記述されていない,グリセロール及び他の浸透圧保護剤の生合成及び利用,カロテノイド生合成経路,反応性酸素スカベンジャー酵素及び分子シャペロン(熱ショック蛋白質)に対する遺伝的土台に,重要で新しい視点を提供した。EST発見はまた浸透圧ストレス応答に関連したRNA干渉及びシグナリング経路の存在を明らかにした。ここで述べた未知のESTsは塩ストレス抵抗性及び他のストレス適応形質の機構的基盤と関連した新しい遺伝子の同定の豊富な資源を提供する。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： タンパク質合成 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *Dunaliella ,  *遺伝子ライブラリー ,  耐塩性 ,  データベース ,  リボソームタンパク質 ,  RT-PCR法 ,  ストレス ,  溶質 ,  スカベンジャー ,  活性酸素 ,  熱ショックタンパク質 ,  カロチノイド ,  RNA干渉
準シソーラス用語： *cDNAライブラリー ,  *Dunaliella salina ,  *EST配列 ,  一次代謝 ,  浸透圧ストレス ,  浸透圧調節物質

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 塩 ,  ショック ,  Dunaliella ,  発現配列タグ ,  EST ,  プロファイリング ,  蛋白質合成 ,  発現