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J-GLOBAL ID：201002290864917306   整理番号：10A0004879

全細菌プロテオームの高処理プロテオミックス分析のための加速された消化

Accelerated digestion for high-throughput proteomics analysis of whole bacterial proteomes

著者 (8件)： VAEZZADEH Ali R. (Biomedical Proteomics Res. Group, Dep. of Structural Biology and Bioinformatics, Geneva Univ., 1 Michel Servet ...) ,  DESHUSSES Jacques M.P. (Biomedical Proteomics Res. Group, Dep. of Structural Biology and Bioinformatics, Geneva Univ., 1 Michel Servet ...) ,  WARIDEL Patrice (Protein Analysis Facility, Center for Integrative Genomics, Lausanne Univ., Lausanne, CHE) ,  FRANCOIS Patrice (Genomic Res. Lab., Geneva Univ. Hospital, rue Gabrielle Perret-Gentil 4, Geneva, CHE) ,  ZIMMERMANN-IVOL Catherine G. (Biomedical Proteomics Res. Group, Dep. of Structural Biology and Bioinformatics, Geneva Univ., 1 Michel Servet ...) ,  LESCUYER Pierre (Biomedical Proteomics Res. Group, Dep. of Structural Biology and Bioinformatics, Geneva Univ., 1 Michel Servet ...) ,  SCHRENZEL Jacques (Genomic Res. Lab., Geneva Univ. Hospital, rue Gabrielle Perret-Gentil 4, Geneva, CHE) ,  HOCHSTRASSER Denis F. (Biomedical Proteomics Res. Group, Dep. of Structural Biology and Bioinformatics, Geneva Univ., 1 Michel Servet ...)
資料名： Journal of Microbiological Methods  (Journal of Microbiological Methods)
巻： 80  号： 1  ページ： 56-62  発行年： 2010年01月 
JST資料番号： H0882A  ISSN： 0167-7012  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ボトムアップされたプロテオミックスにおいて,迅速かつ効果的な蛋白質の消化はデータの信頼性を得るために極めて重要である。しかしながら,プロテオミックスの作業の流れにおいて,試料調整は速度を制限するステップの1つとなっている。ここでは,慣行のトリプシン消化法を,マイクロ波補助消化に基づく2つの短時間消化促進法とを比べた。本手法は,ヒトの病原細菌Staphylococcus aureusの細胞膜を多量に含有する蛋白質の調整に用いられた。ショットガンプロテオミックスにおいて,慣行のLC-MS/MS工程の前に,IPG-IEFによるペプチド分離を行う方法のショットガンIPG-IEF法によって,得られたペプチドを分析した。2つのLC-MS/MSプラットフォームで得られたデータから,開発した消化促進プロトコルは,特にマイクロ波照射による方法において,トリプシンの切断特性を高め,疎水性の膜蛋白質の消化効率を改善した。高処理プロテオミックスと加速された高効率の試料調整法との組合わせ法は,試料採集から結果取得までの時間を短縮することができ,プロテオミックスの実用性を高める方法となる。Copyright 2009 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *細菌 ,  プロテオミクス ,  トリプシン ,  マイクロ波照射 ,  タンパク質代謝 ,  タンパク質分解 ,  黄色ぶどう球菌 ,  LC-MS分析 ,  タンデム質量分析
準シソーラス用語： Staphylococcus aureus ,  ショットガンプロテオミクス ,  LC-MS/MS分析

分類 (1件)： 微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 細菌 ,  プロテオーム ,  プロテオミックス ,  分析 ,  加速 ,  消化