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J-GLOBAL ID：201002294009376450   整理番号：10A0327891

海洋堆積物中の嫌気性アンモニウム酸化細菌の16S rRNA及びヒドラジンオキシドレダクターゼ遺伝子を検出するためのプライマーセットの比較

A comparison of primer sets for detecting 16S rRNA and hydrazine oxidoreductase genes of anaerobic ammonium-oxidizing bacteria in marine sediments

著者 (4件)： LI Meng (Univ. Hong Kong, Hong Kong, SAR, CHN) ,  HONG Yiguo (South China Sea Inst. of Oceanography, Chinese Acad. of Sci., Guangzhou, CHN) ,  KLOTZ Martin Gunter (Univ. Louisville, KY, USA) ,  GU Ji-Dong (Univ. Hong Kong, Hong Kong, SAR, CHN)
資料名： Applied Microbiology and Biotechnology  (Applied Microbiology and Biotechnology)
巻： 86  号： 2  ページ： 781-790  発行年： 2010年03月 
JST資料番号： H0764A  ISSN： 0175-7598  CODEN： EJABDD  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Anammox細菌の16S rRNA及びヒドラジンオキシドレダクターゼ遺伝子hzoを標的する公開プライマーセットを比較し,同一潮間帯堆積物試料でのAnammox細菌検出に対して特異性及び効率を比較した。最適16S rRNA遺伝子標的プライマー及び新設計hzo遺伝子プライマーセットを3種類堆積物試料中のAnammox細菌検出に応用した。試料は長期間水産養殖ゾーン,湿地,原始の人類の干渉が異なる海洋環境から収集した。16S rRNA遺伝子配列及びHZO蛋白質配列に基づく系統樹を作製した。環境に及ぼすヒトの影響に関連した,部位特異的微生物群集構造を持つ海洋環境でのAnammox細菌の高い多様性が明らかになった。

シソーラス用語： 嫌気性処理 ,  微生物学的酸化 ,  *rRNA遺伝子 ,  *オキシドレダクターゼ ,  *プライマー【遺伝】 ,  潮間帯堆積物 ,  生物多様性 ,  湿地 ,  養殖 ,  系統樹 ,  アミノ酸配列
準シソーラス用語： *16S rRNA遺伝子 ,  Anammox ,  *Anammox細菌 ,  アンモニウム酸化細菌 ,  *ヒドラジンオキシドレダクターゼ ,  水産養殖 ,  *微生物群集構造 ,  微生物多様性

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (8件)： 海洋堆積物 ,  嫌気性 ,  アンモニウム ,  酸化 ,  細菌 ,  rRNA ,  遺伝子 ,  プライマー