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J-GLOBAL ID：201002294064660604   整理番号：10A0611282

粗スケールPBNモデリングが確率論的マスター方程式モデルによって表現した遺伝的調節ネットワークの動力学および介入性能に及ぼす影響

Characterizing the Effect of Coarse-Scale PBN Modeling on Dynamics and Intervention Performance of Genetic Regulatory Networks Represented by Stochastic Master Equation Models

著者 (2件)： PAL Ranadip (Texas Tech Univ., TX, USA) ,  BHATTACHARYA Sonal (Texas Tech Univ., TX, USA)
資料名： IEEE Transactions on Signal Processing  (IEEE Transactions on Signal Processing)
巻： 58  号： 6  ページ： 3341-3351  発行年： 2010年06月 
JST資料番号： C0228A  ISSN： 1053-587X  CODEN： ITPRED  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子調整ネットワークの数学的モデリングでは,二つの目標がある。一つは,遺伝子間の相互作用や諸関係のよりよい理解,もう一つは治療法の介入戦略の設計と解析である。そのための方策の一つとして,ここでは,化学マスター方程式(CME)によって表現される精スケール確率論的モデルから確率的Boolネットワーク(PBN)によって表現される粗スケールモデルへの縮小写像について述べる。この写像は破壊されたCMEモデルの定常状態分布を保存する。制御されたPBNおよび制御されたCMEの破壊された定常状態確率分布類似性に対して十分条件を与えるパラメータを定式化した。両者の定常状態確率分布を差の限界を導いた。縮小ネットワークを精スケールモデルへ応用した場合の設計制御方針の効果について,二つの生物学的例を通し評価した。シミュレーションの結果,精スケールへ制御方針を応用した結果はPBNモデルを持って得られた結果と差がないことがわかった。

シソーラス用語： *ネットワーク ,  Markov連鎖 ,  確率的計画法 ,  確率モデル ,  *マスタ方程式 ,  状態 ,  確率分布
準シソーラス用語： *Booleネットワーク ,  Markovチェイン ,  *マスター方程式 ,  確率ネットワーク ,  確率的プログラミング ,  確率的モデル ,  定常状態

分類 (2件)： 電話・データ通信・交換一般  (ND11010T) ,  計算機網  (JC03000K)

タイトルに関連する用語 (8件)： スケール ,  PBN ,  モデリング ,  マスター方程式 ,  モデル ,  表現 ,  遺伝的調節 ,  動力学