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J-GLOBAL ID：201002294314373479   整理番号：10A1615184

トウモロコシの葉の発生に伴うトランスクリプトームの動態

The developmental dynamics of the maize leaf transcriptome

著者 (16件)： LI Pinghua (Cornell Univ., New York, USA) ,  WANG Lin (Cornell Univ., New York, USA) ,  KEBROM Tesfamichael H (Cornell Univ., New York, USA) ,  BRUTNELL Thomas P (Cornell Univ., New York, USA) ,  PONNALA Lalit (Cornell Univ., New York, USA) ,  MYERS Christopher R (Cornell Univ., New York, USA) ,  SUN Qi (Cornell Univ., New York, USA) ,  GANDOTRA Neeru (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  TAUSTA S Lori (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  NELSON Timothy (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  SI Yaqing (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  LIU Peng (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  PROVART Nicholas (Univ. Toronto, Ontario, CAN) ,  PATEL Rohan (Univ. Toronto, Ontario, CAN) ,  REIDEL Edwin J (Cornell Univ., New York, USA) ,  TURGEON Robert (Cornell Univ., New York, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 42  号： 12  ページ： 1060-1067  発行年： 2010年12月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イルミナ社の塩基配列決定技術を利用してトウモロコシの葉のトランスクリプトームを解析した。1億2,000万本を超えるリードの位置を特定することにより,遺伝子の構造および選択的スプライシングの発現が明らかにされ,葉の発生時の勾配に沿った転写物量,ならびに成熟した維管束鞘および葉肉の細胞内の転写物量が定量された。多くのトウモロコシ遺伝子に関して,mRNAには差次的なプロセシングが見出された。遺伝子の64%は発生時の勾配に沿って差次的に発現しており,維管束鞘細胞と葉肉細胞の間でも21%の遺伝子に差次的発現が認められた。我々は電子蛍光ピクトグラフブラウザー「Gブラウズ(Gbrowse)」を実装し,二細胞生化学的経路ビューアーを作成してデータセットを可視化した。データのクラスター解析によって動的なトランスクリプトームが明らかになり,葉身基部の一次細胞壁および基礎的細胞代謝の転写物は,葉端に向かって二次細胞壁の生合成およびC₄光合成系の発達に関する転写物に遷移していった。このデータセットは,光合成系の発達を理解するためのシステム生物学的研究の基盤として有用と考えられる。Copyright Nature Publishing Group 2010

シソーラス用語： *トウモロコシ ,  葉 ,  *トランスクリプトーム ,  選択的スプライシング ,  mRNA ,  クラスタ分析 ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝子発現 ,  植物細胞
準シソーラス用語： 維管束鞘細胞 ,  葉肉細胞

分類 (2件)： トウモロコシ  (FC03034D) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： トウモロコシ ,  葉 ,  トランスクリプトーム