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J-GLOBAL ID：201002294599381410   整理番号：10A0725118

新しいP_II蛋白質構造により,2-オキソグルタール酸結合部位を同定する

A New P_II Protein Structure Identifies the 2-Oxoglutarate Binding Site

著者 (6件)： TRUAN Daphne (Macromolecular Crystallography, Swiss Light Source, Villigen PSI, CHE) ,  HUERGO Luciano F. (Instituto Nacional de Ciencia e Tecnologia da Fixacao Biologica de Nitrogenio, Departamento de Bioquimica e Biologia ...) ,  CHUBATSU Leda S. (Instituto Nacional de Ciencia e Tecnologia da Fixacao Biologica de Nitrogenio, Departamento de Bioquimica e Biologia ...) ,  MERRICK Mike (Dep. of Molecular Microbiology, John Innes Center, Norwich, GBR) ,  LI Xiao-dan (Biomolecular Res., Paul Scherrer Inst., Villigen PSI, CHE) ,  WINKLER Fritz K. (Biomolecular Res., Paul Scherrer Inst., Villigen PSI, CHE)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 400  号： 3  ページ： 531-539  発行年： 2010年07月16日 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌,古細菌及び植物のP_II蛋白質群は窒素代謝の多数の局面を調節する。これらは酵素,転写因子または膜蛋白質であるこれらの標的蛋白質との相互作用によりそれを果たす。細胞窒素状態を感知し,それに応じてこれらの標的と相互作用するP_II蛋白質群の機能の重要特性は,重要な代謝中間体2-オキソグルタル酸(2-OG)のこれらの結合である。しかしながら,P_II蛋白質群におけるこのリガンドの結合部位は論争中である。ここに,MgATP及び2-OGと複合体を形成したAzospirillum brasilense P_II蛋白質GlnZの1.4ÅでのX線構造を測定した。この構造はさまざまなP_II蛋白質群への2-OG結合に関する先の生化学データと見事に一致し,2-OGはヘテロ三量体の隣接サブユニット間で形成された裂部において結合することを示した。結合2-OGの2-オキソ酸分子はATPの3つのホスファート酸素及びTループ残基Gln39の側鎖と共に結合Mg²⁺に連結した。これらの構造は,著者がP_II蛋白質のTループに結合する2-OGを報告した先のMethanococcus jannaschii GlnK1蛋白質の構造と全く対照的であった。この新規構造を考慮して,異なるエフェクタ結合様式で各々結合した及び保存Lys58残基のアンモニウム基の異なる相互作用パートナーにより特性化されたTループ構造の3ファミリーは,P_II蛋白質群によるエフェクタシグナル産物の共通の構造基盤として出現した。Copyright 2010 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 窒素代謝 ,  *アダプタータンパク質 ,  結合部位 ,  代謝産物 ,  *Azospirillum ,  X線構造解析 ,  三量体 ,  サブユニット ,  アミノ酸残基 ,  ループ構造 ,  アミノ酸配列 ,  種差 ,  相同性 ,  *結晶構造 ,  脂肪族ケトン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ケト酸 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： *Azospirillum brasilense ,  *GlnZ蛋白質 ,  *PII蛋白質 ,  ヘテロ三量体

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (1件)： 2-オキソグルタル酸

タイトルに関連する用語 (4件)： PII蛋白質 ,  グルタール酸 ,  結合部位 ,  同定