文献

J-GLOBAL ID：201002296680331277   整理番号：10A0379097

ウラシルを含むDNA中フラノース環動力学の固体状態²H NMR解析

Solid State ²H NMR Analysis of Furanose Ring Dynamics in DNA Containing Uracil

著者 (5件)： KINDE-CARSON Monica N. (Univ. Nebraska, Nebraska) ,  FERGUSON Crystal (Missouri State Univ., Missouri) ,  OYLER Nathan A. (Univ. Missouri-Kansas City, Missouri) ,  HARBISON Gerard S. (Univ. Nebraska, Nebraska) ,  MEINTS Gary A. (Missouri State Univ., Missouri)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 114  号： 9  ページ： 3285-3293  発行年： 2010年03月11日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNA構造の一貫性は適切な細胞機能とゲノム生存性のため維持されなければならぬ。数多くの過程はアルキル化,酸化,脱アミノ化及び不適正ヌクレオチド組込みを含むDNA中単一塩基病変及びミスマッチを創製する。DNA中ウラシルのような単一塩基病変は細胞毒性及び突然変異誘発性であり,除去塩基修復過程間にDNAグリコシラーゼによって認識される。病変ヌクレオチドの動力学的成分または柔軟性はDNA病変の生物学的認識過程に重要役割を演じ,病変部位の局所柔軟性の認識はグリコシラーゼによる同定に対する第一段階である。ウラシル:アデニン(U:A)塩基対内部のフラノース環の局所動力学を直接観測するために固体状態重水素核磁気共鳴を用い,基準チミン:アデニン(T:A)塩基対と比較した。四重極スピンエコー線形,<T_1z>と<T_2r>緩和データを収集し,計算機モデリングを行った。結果は緩和時間が実験誤差内で同じであり,固体線形はノイズレベル以上で実質上区別ができず,この線形を顕著な局所運動をもたないモデルでもって最高にあてはめた。それゆえ,U:A塩基対フラノース環は基準T:A塩基対と同じ動力学的性質をもつように見え,フランース環の局所動力学はU:A塩基対におけるウラシル認識と特異性に対する唯一の決定者ではなさそうである。

シソーラス用語： *ピリミジン塩基 ,  *プリン塩基 ,  *塩基対 ,  *動特性 ,  重水素NMR ,  *緩和時間 ,  スペクトル線形 ,  局所性 ,  DNAグリコシラーゼ ,  除去修復 ,  擬回転 ,  回転角 ,  角度依存性 ,  スピンエコー ,  曲線あてはめ ,  雑音指数 ,  窒素複素環化合物 ,  ウレア化合物 ,  ヒドロキシ化合物
準シソーラス用語： ノイズレベル ,  局所病変 ,  除去DNA修復 ,  動力学的性質

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  有機化合物のNMR  (BM07044Q)

物質索引 (3件)： アデニン ,  ウラシル ,  チミン

タイトルに関連する用語 (7件)： ウラシル ,  DNA ,  環 ,  動力学 ,  固体状態 ,  NMR ,  解析