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J-GLOBAL ID：201002297989483922   整理番号：10A1086409

CyBaseにおける環状蛋白質の解析と分類

Analysis and Classification of Circular Proteins in CyBase

著者 (2件)： KAAS Quentin (Univ. Queensland, QLD, AUS) ,  CRAIK David J. (Univ. Queensland, QLD, AUS)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 94  号： 5  ページ： 584-591  発行年： 2010年 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原核生物および真核生物の環状蛋白質に関する塩基配列,アミノ酸配列,三次元構造あるいは文献を記載したデータベースCyBaseによる環状蛋白質及び前駆体アラインメント,質量分析フィンガープリント解析結果の検索法につき述べた。これらツールを利用することで新規の環状蛋白質の発見や設計あるいはドメインの機能解析や相互作用解析が可能となる。CyBaseを利用することでシクロチド前駆体の環化機構やドメインの配置が解明でき,アカネ科,スミレ科などのシクチド構造に基いた小胞体シグナルペプチド,プロ領域,N末端反復配列,シクロチドドメイン,C末端領域などの特徴的構造の抽出と有効ペプチドの設計などへの利用が期待される。

シソーラス用語： データベース ,  *シクロペプチド ,  アミノ酸配列 ,  生理活性ペプチド ,  生体物質類似体 ,  ペプチド合成 ,  分子設計 ,  *植物タンパク質
準シソーラス用語： CyBase ,  *シクロチド

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 環状 ,  蛋白質 ,  解析 ,  分類