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J-GLOBAL ID：201002299759930655   整理番号：10A0577106

自動化DNA組み立てのためのアルゴリズム

Algorithms for automated DNA assembly

著者 (9件)： DENSMORE Douglas (Joint BioEnergy Inst., CA) ,  DENSMORE Douglas (Univ. California, CA) ,  HSIAU Timothy H.-C. (Univ. California, CA) ,  KITTLESON Joshua T. (Univ. California, CA) ,  DELOACHE Will (Univ. California, CA) ,  DELOACHE Will (Davidson Coll., NC) ,  BATTEN Christopher (Cornell Univ., NY) ,  ANDERSON J. Christopher (Univ. California, CA) ,  ANDERSON J. Christopher (Berkeley National Lab., CA, USA)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 38  号： 8  ページ： 2607-2616  発行年： 2010年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コンピューターアルゴリズムを用いてDNA製作のデザインを自動化することにより,生物工学実験を遂行するために必要な時間とコストを最少化できる。本稿では関連するDNA配列の集合を同時に組み立てることを最適化するアルゴリズムを提供する。小さい合成データセットについての徹底的な検索に関して本アルゴリズムを比較し,本アルゴリズムが最適な解決を素早く見いだせることを示した。2つの現実のデータセットに関するランダム検索手法による比較は,本アルゴリズムが大きいデータセットに関する低コストの解決も素早く見いだすことを示した。

シソーラス用語： *計算機アルゴリズム ,  効果 ,  *分子設計 ,  *ヌクレオチド配列 ,  最適化 ,  プラスミド ,  ベクター
準シソーラス用語： *コンピュータアルゴリズム ,  コストパフォーマンス ,  ファージミド

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  情報処理一般  (JE15010U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 自動化 ,  DNA ,  組み立て ,  アルゴリズム