特許
J-GLOBAL ID:201003074185946355

ブルーベリー品種の識別方法

発明者:
出願人/特許権者:
代理人 (4件): 平木 祐輔 ,  石井 貞次 ,  藤田 節 ,  深見 伸子
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2008-267262
公開番号(公開出願番号):特開2010-094070
出願日: 2008年10月16日
公開日(公表日): 2010年04月30日
要約:
【課題】識別能の高いSSRマーカーによって多種のブルーベリー品種を精度よく、しかも迅速かつ簡便に識別する手段を提供すること。【解決手段】被検試料より抽出したDNAを鋳型とし、ブルーベリー染色体上に存在する特定のSSRマーカーの1種又は複数種をPCRにより増幅し、増幅断片長を解析して、被検試料中のブルーベリー品種を識別する方法。【選択図】なし
請求項(抜粋):
以下の(A)〜(K)の1種または複数種のプライマー対を用いて被検試料から抽出したDNAを鋳型としてPCRによりSSRマーカーを増幅し、増幅断片長を解析して、被検試料中のブルーベリー品種を識別することを特徴とする、ブルーベリー品種の識別方法。 (A)配列番号1に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号2に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.01増幅用プライマー対 5'-gacatgtcttcagagttctcctc-3' (配列番号1) 5'-gcgtgagggcacaaagctct-3' (配列番号2) (B)配列番号3に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号4に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.03増幅用プライマー対 5'-gagaagtagagtttagaagctctagaattca-3' (配列番号3) 5'-tctccaaccccagtaattaagccca-3' (配列番号4) (C)配列番号5に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号6に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.04増幅用プライマー対 5'-tttcattactgctatcgccactcct-3' (配列番号5) 5'-gtctgggataaatacaaacccagttaga-3' (配列番号6) (D)配列番号7に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号8に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.05増幅用プライマー対 5'-gtcatgaccagtaatcaaaccgcgt-3' (配列番号7) 5'-aactagctagtggaaacaaccgggtt-3' (配列番号8) (E)配列番号9に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号10に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.06増幅用プライマー対 5'-gtgtcagagggcacattcatg-3' (配列番号9) 5'-cggctcgtttgcagcctagt-3' (配列番号10) (F)配列番号11に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号12に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.09増幅用プライマー対 5'-ccttcctgcntgaagagaaaaattgca-3' (配列番号11) 5'-tgaaacccctgaaatcgtactctct-3' (配列番号12) (G)配列番号13に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号14に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.17増幅用プライマー対 5'-gttgaaaagttcgttttggtccctcct-3' (配列番号13) 5'-ctccgctgtgttgcttttggattttaga-3' (配列番号14) (H)配列番号15に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号16に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.19増幅用プライマー対 5'- ggtacaaaaccctcgaacagaatctca-3' (配列番号15) 5'- gtgtataacagaagactgctttgctgga-3' (配列番号16) (I)配列番号17に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号18に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.22増幅用プライマー対 5'-cacattcactcaccatgttgcaacg-3' (配列番号17) 5'-gtttgagatttgaccatgccttctgatgt-3' (配列番号18) (J)配列番号19に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号20に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.23増幅用プライマー対 5'-caacgcatttacaccatccggtaaga-3' (配列番号19) 5'-gttcaagtcaacacagaccccattct-3' (配列番号20) (K)配列番号21に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号22に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.24増幅用プライマー対 5'-caaagggatagctcaaagggtcttttca-3' (配列番号21) 5'-gaattttgcgttcgtccgcagatatga-3' (配列番号22)
IPC (4件):
C12Q 1/68 ,  C12N 15/09 ,  C12Q 1/02 ,  G01N 27/447
FI (6件):
C12Q1/68 A ,  C12N15/00 A ,  C12Q1/02 ,  G01N27/26 301A ,  G01N27/26 331E ,  G01N27/26 315K
Fターム (24件):
4B024AA08 ,  4B024AA11 ,  4B024AA20 ,  4B024CA01 ,  4B024CA20 ,  4B024HA11 ,  4B024HA20 ,  4B063QA13 ,  4B063QA17 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ04 ,  4B063QQ09 ,  4B063QQ42 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR35 ,  4B063QR40 ,  4B063QR42 ,  4B063QR62 ,  4B063QS16 ,  4B063QS25 ,  4B063QS36 ,  4B063QS39 ,  4B063QX01

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