特許
J-GLOBAL ID:201003074185946355
ブルーベリー品種の識別方法
発明者:
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出願人/特許権者:
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代理人 (4件):
平木 祐輔
, 石井 貞次
, 藤田 節
, 深見 伸子
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2008-267262
公開番号(公開出願番号):特開2010-094070
出願日: 2008年10月16日
公開日(公表日): 2010年04月30日
要約:
【課題】識別能の高いSSRマーカーによって多種のブルーベリー品種を精度よく、しかも迅速かつ簡便に識別する手段を提供すること。【解決手段】被検試料より抽出したDNAを鋳型とし、ブルーベリー染色体上に存在する特定のSSRマーカーの1種又は複数種をPCRにより増幅し、増幅断片長を解析して、被検試料中のブルーベリー品種を識別する方法。【選択図】なし
請求項(抜粋):
以下の(A)〜(K)の1種または複数種のプライマー対を用いて被検試料から抽出したDNAを鋳型としてPCRによりSSRマーカーを増幅し、増幅断片長を解析して、被検試料中のブルーベリー品種を識別することを特徴とする、ブルーベリー品種の識別方法。
(A)配列番号1に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号2に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.01増幅用プライマー対
5'-gacatgtcttcagagttctcctc-3' (配列番号1)
5'-gcgtgagggcacaaagctct-3' (配列番号2)
(B)配列番号3に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号4に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.03増幅用プライマー対
5'-gagaagtagagtttagaagctctagaattca-3' (配列番号3)
5'-tctccaaccccagtaattaagccca-3' (配列番号4)
(C)配列番号5に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号6に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.04増幅用プライマー対
5'-tttcattactgctatcgccactcct-3' (配列番号5)
5'-gtctgggataaatacaaacccagttaga-3' (配列番号6)
(D)配列番号7に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号8に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.05増幅用プライマー対
5'-gtcatgaccagtaatcaaaccgcgt-3' (配列番号7)
5'-aactagctagtggaaacaaccgggtt-3' (配列番号8)
(E)配列番号9に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号10に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.06増幅用プライマー対
5'-gtgtcagagggcacattcatg-3' (配列番号9)
5'-cggctcgtttgcagcctagt-3' (配列番号10)
(F)配列番号11に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号12に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.09増幅用プライマー対
5'-ccttcctgcntgaagagaaaaattgca-3' (配列番号11)
5'-tgaaacccctgaaatcgtactctct-3' (配列番号12)
(G)配列番号13に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号14に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.17増幅用プライマー対
5'-gttgaaaagttcgttttggtccctcct-3' (配列番号13)
5'-ctccgctgtgttgcttttggattttaga-3' (配列番号14)
(H)配列番号15に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号16に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.19増幅用プライマー対
5'- ggtacaaaaccctcgaacagaatctca-3' (配列番号15)
5'- gtgtataacagaagactgctttgctgga-3' (配列番号16)
(I)配列番号17に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号18に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.22増幅用プライマー対
5'-cacattcactcaccatgttgcaacg-3' (配列番号17)
5'-gtttgagatttgaccatgccttctgatgt-3' (配列番号18)
(J)配列番号19に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号20に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.23増幅用プライマー対
5'-caacgcatttacaccatccggtaaga-3' (配列番号19)
5'-gttcaagtcaacacagaccccattct-3' (配列番号20)
(K)配列番号21に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーと配列番号22に示す塩基配列を含むオリゴヌクレオチドプライマーからなるSSRマーカーVacc.24増幅用プライマー対
5'-caaagggatagctcaaagggtcttttca-3' (配列番号21)
5'-gaattttgcgttcgtccgcagatatga-3' (配列番号22)
IPC (4件):
C12Q 1/68
, C12N 15/09
, C12Q 1/02
, G01N 27/447
FI (6件):
C12Q1/68 A
, C12N15/00 A
, C12Q1/02
, G01N27/26 301A
, G01N27/26 331E
, G01N27/26 315K
Fターム (24件):
4B024AA08
, 4B024AA11
, 4B024AA20
, 4B024CA01
, 4B024CA20
, 4B024HA11
, 4B024HA20
, 4B063QA13
, 4B063QA17
, 4B063QA18
, 4B063QQ04
, 4B063QQ09
, 4B063QQ42
, 4B063QR08
, 4B063QR32
, 4B063QR35
, 4B063QR40
, 4B063QR42
, 4B063QR62
, 4B063QS16
, 4B063QS25
, 4B063QS36
, 4B063QS39
, 4B063QX01
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