特許
J-GLOBAL ID：201003087078295834
リグノセルロース性物質を処理する酵素、前記をコードする核酸並びに前記を製造及び使用する方法
発明者：
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出願人/特許権者：
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代理人 (6件)：
熊倉 禎男
, 小川 信夫
, 箱田 篤
, 浅井 賢治
, 山崎 一夫
, 滝澤 敏雄
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2009-548427
公開番号（公開出願番号）：特表2010-516296
出願日： 2008年01月30日
公開日（公表日）： 2010年05月20日
要約：
本発明は、リグノセルロース分解活性、例えばグリコシルヒドロラーゼ、セルラーゼ、エンドグルカナーゼ、セロビオヒドロラーゼ、ベータ-グルコシダーゼ、キシラナーゼ、マンナナーゼ、キシロシダーゼ(例えばβ-キシロシダーゼ)、アラビノフラノシダーゼ、及び/又はグルコースオキシダーゼ活性を有するポリペプチド、これらポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、並びに、これらポリヌクレオチド及びポリペプチドを製造及び使用する方法を提供する。ある特徴では、本発明は、サトウキビバガスを酵素的に処理する(加水分解する)ことができる、すなわちサトウキビバガスの分解用、又はバイオマス加工用のポリペプチド、及びこれらの酵素をコードするポリヌクレオチド、並びにこれらポリヌクレオチド及びポリペプチドを製造及び使用する方法を提供する。ある実施態様では、本発明は、本発明のポリペプチドの熱安定型及び耐熱型を提供する。本発明のポリペプチドは、多様な医薬的、農業的及び工業的関係で用いることができる。例えば、本発明は、砂糖工場で処理されるサトウキビのバガス成分中の多糖類を加水分解することができる多酵素系を提供する。本発明は、リグノセルロース系残留物の醗酵性糖へのバイオ変換用酵素を提供し、さらにこれら糖類は、エタノール及び燃料(バイオ燃料、例えばバイオエタノール、バイオプロパノール、バイオブタノール及びバイオディーゼルを含む)製造用のフィードストックケミカルとして用いることができる。
請求項（抜粋）：
以下の(a)-(j)を含む、単離、合成又は組換え核酸:
(a)配列番号:1、配列番号:3、 配列番号:5、配列番号:7、配列番号:9、配列番号:11、配列番号:13、配列番号:15、配列番号:17、配列番号:19、配列番号:21、配列番号:23、配列番号:25、配列番号:27、配列番号:29、配列番号:31、配列番号:33、配列番号:35、配列番号:37、配列番号:39、配列番号:41、配列番号:43、配列番号:45、配列番号:47、配列番号:49、配列番号:51、配列番号:53、配列番号:55、配列番号:57、配列番号:59、配列番号:61、配列番号:63、配列番号:65、配列番号:67、配列番号:69、配列番号:71、配列番号:73、配列番号:75、配列番号:77、配列番号:79、配列番号:81、配列番号:83、配列番号:85、配列番号:87、配列番号:89、配列番号:91、配列番号:93、配列番号:95、配列番号:97、配列番号:99、配列番号:101、配列番号:103、配列番号:105、配列番号:107、配列番号:109、配列番号:111、配列番号:113、配列番号:115、配列番号:117、配列番号:119、配列番号:121、配列番号:123、配列番号:125、配列番号:127、配列番号:129、配列番号:131、配列番号:133、配列番号:135、配列番号:137、配列番号:139、配列番号:141、配列番号:143、配列番号:145、配列番号:147、配列番号:149、配列番号:151、配列番号:153、配列番号:155、配列番号:157、配列番号:159、配列番号:161、配列番号:163、配列番号:165、配列番号:167、配列番号:169、配列番号:171、配列番号:173、配列番号:175、配列番号:177、配列番号:179、配列番号:181、配列番号:183、配列番号:185、配列番号:187、配列番号:189、配列番号:191、配列番号:193、配列番号:195、配列番号:197、配列番号:199、配列番号:201、配列番号:203、配列番号:205、配列番号:207、配列番号:209、配列番号:211、配列番号:213、配列番号:215、配列番号:217、配列番号:219、配列番号:221、配列番号:223、配列番号:225、配列番号:227、配列番号:229、配列番号:231、配列番号:233、配列番号:235、配列番号:237、配列番号:239、配列番号:241、配列番号:243、配列番号:245、配列番号:247、配列番号:249、配列番号:251、配列番号:253、配列番号:255、配列番号:257、配列番号:259、配列番号:261、配列番号:263、配列番号:265、配列番号:267、配列番号:269、配列番号:271、配列番号:273、配列番号:275、配列番号:277、配列番号:279、配列番号:281、配列番号:283、配列番号:285、配列番号:287、配列番号:289、配列番号:291、配列番号:293、配列番号:295、配列番号:297、配列番号:299、配列番号:301、配列番号:303、配列番号:305、配列番号:307、配列番号:309、配列番号:311、配列番号:313、配列番号:315、配列番号:317、配列番号:319、配列番号:321、配列番号:323、配列番号:325、配列番号:327、配列番号:329、配列番号:331、配列番号:333、配列番号:335、配列番号:337、配列番号:339、配列番号:341、配列番号:343、配列番号:345、配列番号:347、配列番号:349、配列番号:351、配列番号:353、配列番号:355、配列番号:357、配列番号:359、配列番号:361、配列番号:363、配列番号:365、配列番号:367、配列番号:369、配列番号:370、配列番号:372、配列番号:373、配列番号:375、配列番号:376、配列番号:378、配列番号:379、配列番号:381、配列番号:382、配列番号:384、配列番号:385、配列番号:387、配列番号:388、配列番号:390、配列番号:391、配列番号:393、配列番号:394、配列番号:396、配列番号:397、配列番号:399、配列番号:400、配列番号:402、配列番号:403、配列番号:405、配列番号:406、配列番号:408、配列番号:409、配列番号:411、配列番号:412、配列番号:414、配列番号:415、配列番号:417、配列番号:418、配列番号:420、配列番号:421、配列番号:423、配列番号:425、配列番号:427、配列番号:429、配列番号:431、配列番号:433、配列番号:435、配列番号:437、配列番号:439、配列番号:441、配列番号:443、配列番号:445、配列番号:447、配列番号:449、配列番号:451、配列番号:453、配列番号:455、配列番号:457、配列番号:459、配列番号:461、配列番号:463、配列番号:465、配列番号:467、配列番号:469及び/又は配列番号:471、配列番号:480、配列番号:481、配列番号:482、配列番号:483、配列番号:484、配列番号:485、配列番号:486、配列番号:487、配列番号:488、配列番号:489と配列番号:700の間の全ての奇数番号の配列番号、配列番号:707、配列番号:708、配列番号:709、配列番号:710、配列番号:711、配列番号:712、配列番号:713、配列番号:714、配列番号:715、配列番号:716、配列番号:717、配列番号:718、及び/又は配列番号:720に対して、少なくとも約50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%若しくは前記より高いか又は完全な(100%)配列同一性(相同性)を、少なくとも約20、30、40、50、75、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1000、1050、1100、1150、若しくはそれより長い残基の領域にわたって、又はcDNA、転写物(mRNA)若しくは遺伝子の完全長にわたって有する核酸配列(ポリヌクレオチド)であって、
リグノセルロース系活性を有するポリペプチドをコードするか、又は配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26、配列番号:28、配列番号:30、配列番号:32、配列番号:34、配列番号:36、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:42、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:48、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:54、配列番号:56、配列番号:58、配列番号:60、配列番号:62、配列番号:64、配列番号:66、配列番号:68、配列番号:70、配列番号:72、配列番号:74、配列番号:76、配列番号:78、配列番号:80、配列番号:82、配列番号:84、配列番号:86、配列番号:88、配列番号:90、配列番号:92、配列番号:94、配列番号:96、配列番号:98、配列番号:100、配列番号:102、配列番号:104、配列番号:106、配列番号:108、配列番号:110、配列番号:112、配列番号:114、配列番号:116、配列番号:118、配列番号:120、配列番号:122、配列番号:124、配列番号:126、配列番号:128、配列番号:130、配列番号:132、配列番号:134、配列番号:136、配列番号:138、配列番号:140、配列番号:142、配列番号:143、配列番号:146、配列番号:148、配列番号:150、配列番号:152、配列番号:154、配列番号:156、配列番号:158、配列番号:160、配列番号:162、配列番号:164、配列番号:166、配列番号:168、配列番号:170、配列番号:172、配列番号:174、配列番号:176、配列番号:178、配列番号:180、配列番号:182、配列番号:184、配列番号:186、配列番号:188、配列番号:190、配列番号:192、配列番号:194、配列番号:196、配列番号:198、配列番号:200、配列番号:202、配列番号:204、配列番号:206、配列番号:209、配列番号:210、配列番号:212、配列番号:214、配列番号:216、配列番号:218、配列番号:220、配列番号:222、配列番号:224、配列番号:226、配列番号:228、配列番号:230、配列番号:232、配列番号:234、配列番号:236、配列番号:238、配列番号:240、配列番号:242、配列番号:244、配列番号:246、配列番号:248、配列番号:250、配列番号:252、配列番号:254、配列番号:256、配列番号:258、配列番号:260、配列番号:262、配列番号:264、配列番号:266、配列番号:268、配列番号:270、配列番号:272、配列番号:274、配列番号:276、配列番号:278、配列番号:280、配列番号:282、配列番号:284、配列番号:286、配列番号:288、配列番号:290、配列番号:292、配列番号:294、配列番号:296、配列番号:298、配列番号:300、配列番号:302、配列番号:304、配列番号:306、配列番号:308、配列番号:310、配列番号:312、配列番号:314、配列番号:316、配列番号:318、配列番号:320、配列番号:322、配列番号:324、配列番号:326、配列番号:328、配列番号:330、配列番号:332、配列番号:334、配列番号:336、配列番号:338、配列番号:340、配列番号:342、配列番号:344、配列番号:346、配列番号:348、配列番号:350、配列番号:352、配列番号:354、配列番号:356、配列番号:358、配列番号:360、配列番号:362、配列番号:364、配列番号:366、配列番号:368、配列番号:371、配列番号:374、配列番号:377、配列番号:380、配列番号:383、配列番号:386、配列番号:389、配列番号:392、配列番号:395、配列番号:398、配列番号:401、配列番号:404、配列番号:407、配列番号:410、配列番号:413、配列番号:416、配列番号:419、配列番号:422、配列番号:424、配列番号:426、配列番号:428、配列番号:430、配列番号:432、配列番号:434、配列番号:436、配列番号:438、配列番号:440、配列番号:442、配列番号:444、配列番号:446、配列番号:448、配列番号:450、配列番号:452、配列番号:454、配列番号:456、配列番号:458、配列番号:460、配列番号:462、配列番号:464、配列番号:466、配列番号:468、配列番号:470、及び/又は配列番号:472、配列番号:473、配列番号:474、配列番号:475、配列番号:476、配列番号:477、配列番号:478、配列番号:479、配列番号:490から配列番号:700の間の全ての偶数番号の配列番号、配列番号:719及び/又は配列番号:721、及び/又は酵素的に活性なその部分配列(フラグメント)と特異的に結合する抗体を生成することができるポリペプチド又はペプチドをコードし、ここで、場合によって前記リグノセルロース系活性が、グリコシルトランスフェラーゼ、セルラーゼ、セルロース分解活性、エンドグルカナーゼ、セロビオヒドロラーゼ、ベータ-グルコシダーゼ、キシラナーゼ、マンナナーゼ、β-キシロシダーゼ又はアラビノフラノシダーゼ活性を含み、
さらに場合によって、前記配列同一性が、配列比較アルゴリズムによる分析によって、又は目視精査によって決定され、
さらに場合によって、前記配列比較アルゴリズムがBLASTバージョン2.2.2アルゴリズムを含み、その場合、フィルタリング設定はblastall -p blastp -d “nr pataa” -F Fに設定され、他の全てのオプションは規定値に設定される、前記核酸配列;
(b)ストリンジェントな条件下で(a)の核酸とハイブリダイズする核酸配列(ポリヌクレオチド)であって、前記核酸がリグノセルロース系活性を有するポリペプチドをコードし、さらに場合によって、前記リグノセルロース系活性が、グリコシルトランスフェラーゼ、セルラーゼ、セルロース分解活性、エンドグルカナーゼ、セロビオヒドロラーゼ、ベータ-グルコシダーゼ、キシラナーゼ、マンナナーゼ、β-キシロシダーゼ又はアラビノフラノシダーゼ活性を含み、
さらに前記ストリンジェントな条件が、0.2xSSCにて約65°Cの温度で約15分間の洗浄を含む洗浄工程を含み、
さらに場合によって、前記核酸が、長さが少なくとも約20、30、40、50、75、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900、1000若しくはそれより大きい残基であるか又は遺伝子、cDNA若しくは転写物(mRNA)の完全長である、前記核酸配列;
(c)配列番号:2、配列番号:4、配列番号:6、配列番号:8、配列番号:10、配列番号:12、配列番号:14、配列番号:16、配列番号:18、配列番号:20、配列番号:22、配列番号:24、配列番号:26、配列番号:28、配列番号:30、配列番号:32、配列番号:34、配列番号:36、配列番号:38、配列番号:40、配列番号:42、配列番号:44、配列番号:46、配列番号:48、配列番号:50、配列番号:52、配列番号:54、配列番号:56、配列番号:58、配列番号:60、配列番号:62、配列番号:64、配列番号:66、配列番号:68、配列番号:70、配列番号:72、配列番号:74、配列番号:76、配列番号:78、配列番号:80、配列番号:82、配列番号:84、配列番号:86、配列番号:88、配列番号:90、配列番号:92、配列番号:94、配列番号:96、配列番号:98、配列番号:100、配列番号:102、配列番号:104、配列番号:106、配列番号:108、配列番号:110、配列番号:112、配列番号:114、配列番号:116、配列番号:118、配列番号:120、配列番号:122、配列番号:124、配列番号:126、配列番号:128、配列番号:130、配列番号:132、配列番号:134、配列番号:136、配列番号:138、配列番号:140、配列番号:142、配列番号:143、配列番号:146、配列番号:148、配列番号:150、配列番号:152、配列番号:154、配列番号:156、配列番号:158、配列番号:160、配列番号:162、配列番号:164、配列番号:166、配列番号:168、配列番号:170、配列番号:172、配列番号:174、配列番号:176、配列番号:178、配列番号:180、配列番号:182、配列番号:184、配列番号:186、配列番号:188、配列番号:190、配列番号:192、配列番号:194、配列番号:196、配列番号:198、配列番号:200、配列番号:202、配列番号:204、配列番号:206、配列番号:209、配列番号:210、配列番号:212、配列番号:214、配列番号:216、配列番号:218、配列番号:220、配列番号:222、配列番号:224、配列番号:226、配列番号:228、配列番号:230、配列番号:232、配列番号:234、配列番号:236、配列番号:238、配列番号:240、配列番号:242、配列番号:244、配列番号:246、配列番号:248、配列番号:250、配列番号:252、配列番号:254、配列番号:256、配列番号:258、配列番号:260、配列番号:262、配列番号:264、配列番号:266、配列番号:268、配列番号:270、配列番号:272、配列番号:274、配列番号:276、配列番号:278、配列番号:280、配列番号:282、配列番号:284、配列番号:286、配列番号:288、配列番号:290、配列番号:292、配列番号:294、配列番号:296、配列番号:298、配列番号:300、配列番号:302、配列番号:304、配列番号:306、配列番号:308、配列番号:310、配列番号:312、配列番号:314、配列番号:316、配列番号:318、配列番号:320、配列番号:322、配列番号:324、配列番号:326、配列番号:328、配列番号:330、配列番号:332、配列番号:334、配列番号:336、配列番号:338、配列番号:340、配列番号:342、配列番号:344、配列番号:346、配列番号:348、配列番号:350、配列番号:352、配列番号:354、配列番号:356、配列番号:358、配列番号:360、配列番号:362、配列番号:364、配列番号:366、配列番号:368、配列番号:371、配列番号:374、配列番号:377、配列番号:380、配列番号:383、配列番号:386、配列番号:389、配列番号:392、配列番号:395、配列番号:398、配列番号:401、配列番号:404、配列番号:407、配列番号:410、配列番号:413、配列番号:416、配列番号:419、配列番号:422、配列番号:424、配列番号:426、配列番号:428、配列番号:430、配列番号:432、配列番号:434、配列番号:436、配列番号:438、配列番号:440、配列番号:442、配列番号:444、配列番号:446、配列番号:448、配列番号:450、配列番号:452、配列番号:454、配列番号:456、配列番号:458、配列番号:460、配列番号:462、配列番号:464、配列番号:466、配列番号:468、配列番号:470、及び/又は配列番号:472、配列番号:473、配列番号:474、配列番号:475、配列番号:476、配列番号:477、配列番号:478、配列番号:479、配列番号:490から配列番号:700の間の全ての偶数番号の配列番号、配列番号:719及び/又は配列番号:721、又は酵素的に活性なその部分配列(フラグメント)の配列を有するポリペプチドをコードする核酸配列;
(d)少なくとも1つの保存的アミノ酸置換を有し、かつそのリグノセルロース系活性を保持する、(a)、(b)又は(c)の核酸(ポリヌクレオチド)であって、
場合によって前記保存的アミノ酸置換が、同様な特徴を有する別のアミノ酸によるアミノ酸の置換を含み、さらに場合によって保存的置換が、別の脂肪族アミノ酸による脂肪族アミノ酸の置換、スレオニンによるセリンの置換若しくはその逆、別の酸性残基による酸性残基の置換、別のアミド基保有残基によるアミド基・・・
IPC (29件)：
C12N 15/09
, C12N 9/42
, C12Q 1/68
, C12N 1/15
, C12N 1/19
, C12N 1/21
, C12N 5/10
, A01K 67/027
, A01H 5/00
, C12N 15/113
, C12N 11/00
, C07K 16/40
, C12P 21/02
, C12Q 1/34
, C07K 19/00
, A01H 1/00
, A21D 2/26
, A21D 10/00
, A21D 13/00
, A23L 2/00
, C12C 7/00
, A61K 38/46
, A61P 1/14
, A61P 1/02
, A61P 17/02
, A61L 15/44
, C10L 1/02
, C11D 3/386
, C11D 7/42
C12N15/00 A
, C12N9/42
, C12Q1/68 A
, C12N1/15
, C12N1/19
, C12N1/21
, C12N5/00 101
, A01K67/027
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