石川岳志

イシカワタケシ | Ishikawa Takeshi

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (2件)： http://www.cb.kagoshima-u.ac.jp/lab/ishi/ , http://www.cb.kagoshima-u.ac.jp/lab/ishi/lab_e_index.html

研究分野 (4件)：生物物理学 , 計算科学 , 薬系分析、物理化学 , 基礎物理化学

研究キーワード (12件)：抗体医薬品 , タンパク間相互作用(PPI)解析 , プリオン病創薬 , タンパクータンパクドッキング , 生命計算化学 , PAICS , インシリコ創薬 , フラグメント分子軌道法 , 分子軌道法 , 量子化学 , 計算化学 , 理論化学

競争的資金等の研究課題 (20件)：

2020 - 2023 健診コホートのプロテオミクスと人工知能を基盤とする関節リウマチ個別化予防の構築

2022 - 2023 バイオ医薬品開発の効率化を実現する生体分子量子化学計算プログラム「PAICS」

2020 - 2022 抗プリオン効果を生み出すファーマコフォアモデルの構築と新規治療薬の開発

2018 - 2021 RNAアプタマーの分子認識メカニズムの解明

2017 - 2020 Wet-Dry融合アプローチを用いた産業応用酵素の遷移状態制御による新機能創製

2016 - 2020 東アジア調査に基づくベーチェット病、強皮症の特異的HLAが病態に関わる機序の研究

2016 - 2019 アクチニド分子種と生体分子の相互作用に関する計算化学的研究

2016 - 2019 HLA-ペプチド親和性の網羅的計算法の開発とベーチェット病の病因解明への応用

2015 - 2016 凝集系化学反応の遷移状態計算のための新規手法と汎用ソフトウエアの開発

2015 - 2016 研究会「感染症と計算科学」の開催(2015年11月13日, 琉球大学)

2015 - 2016 新薬創成のためのモバイル端末を利用したシリアスゲームに関する調査研究

2012 - 2015 低分子化合物を用いた揺らぎの制御によるプリオン蛋白質の構造変換抑制

2014 - 2015 熱帯樹木のイソプレン生合成酵素と基質間の相互作用エネルギーの解析

2009 - 2010 第一原理計算によるタンパク場を考慮した部分構造最適化システムの構築

2008 - 2010 FMO法による体内揺らぎを考慮した相互作用解析法の構築とプリオンタンパクへの応用

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論文 (93件)：

Sumire Kousaka, Takeshi Ishikawa. Quantum Chemistry-Based Protein-Protein Docking without Empirical Parameters. Journal of Chemical Theory and Computation. 2024
Wataru Imamura, Tomohiro Yamasaki, Hikaru Kato, Takeshi Ishikawa. Computational study on the inhibition mechanism of cyclodextran against GTF-SI from Streptococcus mutans focusing on the glucan-binding domain. Carbohydrate Polymer Technologies and Applications. 2024. 7. 100473-100473
Satoshi Mizuta, Tomoko Yamaguchi, Masaharu Iwasaki, Takeshi Ishikawa. A facile access to aliphatic trifluoromethyl ketones <i>via</i> photocatalyzed cross-coupling of bromotrifluoroacetone and alkenes. Organic & Biomolecular Chemistry. 2024
Satoshi Mizuta, Tomoko Yamaguchi, Takeshi Ishikawa. Nucleophilic fluorine substitution reaction of α-carbonyl benzyl bromide, phenylthiofluoroalkyl bromide, and 2-bromo-2-phenoxyacetonitrile. RSC Advances. 2024. 14. 27. 19062-19066
Satoshi Mizuta, Masahiro Tabira, Naoki Shichiro, Tomoko Yamaguchi, Jun Ishihara, Takeshi Ishikawa. Reaction Mechanism and Origin of Stereoselectivity in the Fluorination and Trifluoromethylthiolation of 2-Bromoamides with AgF and AgSCF3. European Journal of Organic Chemistry. 2023

MISC (94件)：

特許 (7件)：

書籍 (4件)：

Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method. FMO interfaced with Molecular Dynamics simulation (Chapter 19 : 373-389)
2021
Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method. PAICS: Development of an Open-Source Software of Fragment Molecular Orbital Method for Biomolecule (Chapter 5 : 69-76)
2021
Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method. The ABINIT-MP Program (Chapter 4 : 53-67)
2021
The FRAGMENT MOLECULAR ORBIAL METHOD: Practical Applications to Large Molecular Systems; D. G. Fedorov and K. Kitaura Eds; Developments of FMO Methodology and Graphical User Interface in ABINIT-MP (Chapter 3 : 37-62)
CRC Press, Boca Raton, FL 2009

講演・口頭発表等 (15件)：

Development and Application of a Computational Method for Analyzing Protein-Protein Interaction
(NDSU-KU 7th Annual Symposium 2022)
Development and Application of a Quantum Chemistry-Based Method for Analyzing Protein-Protein Interaction
(The 20th Protein Island Matsuyama International Symposium 2022)
日本コンピュータ化学会2020年秋季年会生命科学を指向した量子化学計算プログラム「PAICS」の開発と応用
(日本コンピュータ化学会2020年秋季年会 2020)
量子化学計算によるRNAウイルス薬剤耐性変異予測の試み
(第9回岐阜構造生物学・医学・論理的創薬シンポジウム(誌上開催へ変更) 2020)
Quantum Chemical Calculation of biomolecule with Fragment Molecular Orbital Method: Program Development and Application to Drug Discovery
(NDSU KU Joint Symposium on Biotechnology, Nanomaterials and Polymers 2019)

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (6件)：

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委員歴 (4件)：

所属学会 (4件)：

日本薬学会 , 日本生物物理学会 , CBI学会 , 日本化学会

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石川 岳志