- 2023 - 2026 種内数千ゲノム比較によるピンポイント適応変異数千の検出
- 2020 - 2023 集団ゲノミクスを用いた社会性進化の解析
- 2019 - 2022 セントロメア進化のミステリーを解き明かす
- 2018 - 2020 腫瘍内ダイバーシティー生成過程のシミュレーション解析
- 2015 - 2018 ゲノムの脆弱部位を利用した適応進化
- 2011 - 2016 集団遺伝学理論と比較ゲノムによる非コードDNA領域の進化メカニズム
- 2011 - 2016 ゲノムを支える非コードDNA領域の機能
- 2010 - 2012 遺伝子消失による適応進化の法則
- 2007 - 2010 遺伝子重複による新規機能獲得遺伝子の同定
- 1998 - 1999 DNA多型に関する理論的研究
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